More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4790 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  99.83 
 
 
577 aa  1181    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  99.83 
 
 
577 aa  1181    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  99.83 
 
 
577 aa  1181    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  66.55 
 
 
594 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  70.68 
 
 
571 aa  845    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  70.68 
 
 
571 aa  849    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 
577 aa  1182    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  99.83 
 
 
577 aa  1179    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  71.03 
 
 
578 aa  866    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  99.65 
 
 
577 aa  1179    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  71.45 
 
 
578 aa  871    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  99.83 
 
 
577 aa  1181    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  90.64 
 
 
577 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  90.64 
 
 
577 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  90.64 
 
 
577 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  86.83 
 
 
577 aa  1041    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  71.03 
 
 
578 aa  866    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  99.83 
 
 
577 aa  1181    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  90.64 
 
 
577 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  99.83 
 
 
577 aa  1181    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  90.29 
 
 
577 aa  1086    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  70.68 
 
 
578 aa  860    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  65.93 
 
 
591 aa  827    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  45.18 
 
 
591 aa  544  1e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  42.17 
 
 
588 aa  497  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  44.27 
 
 
573 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  40.56 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  41.51 
 
 
570 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  40.14 
 
 
582 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  37.42 
 
 
611 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  36.83 
 
 
558 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  36.54 
 
 
573 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  36.28 
 
 
579 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  34.76 
 
 
575 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  34.15 
 
 
582 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  34.08 
 
 
574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  34.78 
 
 
579 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  34.6 
 
 
579 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  34.08 
 
 
574 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  31.43 
 
 
575 aa  319  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  35.82 
 
 
617 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  33.55 
 
 
617 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  35.22 
 
 
575 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  35.98 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
617 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  35.58 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
617 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  35.36 
 
 
583 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  34.41 
 
 
612 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  35.18 
 
 
580 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  34.22 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  32.35 
 
 
608 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  33.45 
 
 
573 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  32.5 
 
 
596 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  32.79 
 
 
636 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  32.83 
 
 
612 aa  294  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  33.33 
 
 
618 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  34.24 
 
 
591 aa  291  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  33.95 
 
 
591 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  31.71 
 
 
621 aa  289  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  33.78 
 
 
591 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  32.13 
 
 
588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  32.72 
 
 
613 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  32 
 
 
609 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
596 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  32.71 
 
 
593 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  30.13 
 
 
584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.75 
 
 
607 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  29.44 
 
 
598 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  27.47 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  27.59 
 
 
612 aa  210  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  29.28 
 
 
603 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.58 
 
 
601 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  27.94 
 
 
597 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  28.77 
 
 
576 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  28.77 
 
 
618 aa  193  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.98 
 
 
609 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  24.66 
 
 
578 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  24.66 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  26.96 
 
 
562 aa  174  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  26.96 
 
 
562 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  26.6 
 
 
604 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  26.6 
 
 
604 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  27.24 
 
 
605 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  26.79 
 
 
604 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  27.2 
 
 
611 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  26.68 
 
 
611 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.7 
 
 
604 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  26.14 
 
 
682 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  31.41 
 
 
1045 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.15 
 
 
605 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  30.66 
 
 
1113 aa  139  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  26.09 
 
 
611 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  25.95 
 
 
605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  31.52 
 
 
1126 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  26.09 
 
 
611 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.09 
 
 
591 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.64 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  25.76 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>