More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2616 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  100 
 
 		 674 aa  1334    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  45.96 
 
 		 665 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  45.1 
 
 		 661 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  45.06 
 
 		 661 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  45.54 
 
 		 661 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  44.04 
 
 		 677 aa  515  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  44.91 
 
 		 652 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  43.5 
 
 		 663 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  37.66 
 
 		 653 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  37.12 
 
 		 653 aa  347  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  32.49 
 
 		 643 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  31.26 
 
 		 620 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  28.08 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  30.05 
 
 		 637 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  32.22 
 
 		 632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  29.01 
 
 		 622 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.57 
 
 		 776 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  27.93 
 
 		 622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.55 
 
 		 647 aa  216  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  29.87 
 
 		 671 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  29.84 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  29.69 
 
 		 639 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 595 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  30.55 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 702 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.64 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  28.21 
 
 		 789 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  26.91 
 
 		 593 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.1 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.32 
 
 		 670 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 588 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 627 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  27.99 
 
 		 627 aa  168  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  27.93 
 
 		 607 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  27.77 
 
 		 607 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  26.4 
 
 		 594 aa  164  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  25.97 
 
 		 613 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  27.33 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  27.89 
 
 		 779 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  24.92 
 
 		 610 aa  141  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  24.92 
 
 		 709 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.89 
 
 		 576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 618 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.44 
 
 		 759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  24.73 
 
 		 757 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.17 
 
 		 609 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.32 
 
 		 751 aa  110  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 913 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.47 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.67 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.2 
 
 		 765 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 575 aa  104  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.2 
 
 		 575 aa  104  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.35 
 
 		 607 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  25.44 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.66 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.86 
 
 		 749 aa  102  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 605 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 605 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  25.21 
 
 		 571 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 583 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  22.74 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.36 
 
 		 765 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  24.86 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  24.86 
 
 		 604 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.03 
 
 		 750 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  24.57 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  24.86 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  23.36 
 
 		 765 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 		 802 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.2 
 
 		 574 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 583 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  23.86 
 
 		 579 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.37 
 
 		 751 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 564 aa  99  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 580 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  24.27 
 
 		 739 aa  97.8  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  22.8 
 
 		 738 aa  97.8  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 583 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.05 
 
 		 579 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  24.06 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.81 
 
 		 784 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 604 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 555 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 596 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 582 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.74 
 
 		 752 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  23.75 
 
 		 705 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 597 aa  94.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25.28 
 
 		 573 aa  94  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 820 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.21 
 
 		 769 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>