More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1562 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  100 
 
 		 779 aa  1536    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  45.27 
 
 		 670 aa  452  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  40.2 
 
 		 709 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.43 
 
 		 702 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  33.46 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  32.36 
 
 		 615 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  31.17 
 
 		 593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.16 
 
 		 776 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.88 
 
 		 595 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  32.88 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.69 
 
 		 622 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.75 
 
 		 595 aa  201  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  30.58 
 
 		 622 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 588 aa  196  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  31.37 
 
 		 665 aa  195  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.16 
 
 		 789 aa  193  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  30.78 
 
 		 632 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 663 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  28.62 
 
 		 613 aa  184  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.67 
 
 		 647 aa  184  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  30 
 
 		 661 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  29.58 
 
 		 661 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 661 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.09 
 
 		 637 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  29.68 
 
 		 639 aa  171  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  29.52 
 
 		 639 aa  170  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  29.92 
 
 		 633 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  27.99 
 
 		 653 aa  165  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  29.52 
 
 		 652 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.86 
 
 		 610 aa  164  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  29.69 
 
 		 620 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  29.28 
 
 		 653 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 674 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  28.7 
 
 		 671 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 643 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.73 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.32 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  26.63 
 
 		 575 aa  145  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  44 
 
 		 677 aa  144  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 627 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  28.88 
 
 		 607 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.31 
 
 		 583 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.58 
 
 		 583 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.44 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.7 
 
 		 607 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.31 
 
 		 580 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  29.3 
 
 		 627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.77 
 
 		 583 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.81 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  25.19 
 
 		 579 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.23 
 
 		 610 aa  128  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  27.42 
 
 		 702 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.33 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.85 
 
 		 555 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.43 
 
 		 770 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 598 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 582 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  25.48 
 
 		 594 aa  104  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.23 
 
 		 603 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  25.2 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  24.39 
 
 		 673 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.96 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 629 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  22.54 
 
 		 578 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 611 aa  101  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  23.73 
 
 		 571 aa  99  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 577 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  24.35 
 
 		 577 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  24.35 
 
 		 577 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26 
 
 		 657 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  24.35 
 
 		 577 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  24.35 
 
 		 577 aa  98.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  24.35 
 
 		 577 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  24.35 
 
 		 577 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 559 aa  98.2  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  24.79 
 
 		 772 aa  98.2  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  24.35 
 
 		 577 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  24.44 
 
 		 588 aa  97.8  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 601 aa  97.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  24.19 
 
 		 597 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 605 aa  97.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  23.33 
 
 		 571 aa  96.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  24.17 
 
 		 577 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.3 
 
 		 677 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  23.24 
 
 		 578 aa  95.1  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.94 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  24.94 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  24.94 
 
 		 577 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.94 
 
 		 577 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.94 
 
 		 577 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.94 
 
 		 577 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  23.37 
 
 		 578 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 758 aa  94  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.3 
 
 		 677 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  23.37 
 
 		 578 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.76 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>