More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3176 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  53.7 
 
 		 603 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  100 
 
 		 601 aa  1207    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  92.63 
 
 		 597 aa  1093    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  54.64 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  47.95 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  32.88 
 
 		 588 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  33.05 
 
 		 582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  32.06 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  32.06 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  32.74 
 
 		 573 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  31.45 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  30.39 
 
 		 596 aa  253  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  32.02 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  32.02 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  30.66 
 
 		 575 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  29.33 
 
 		 570 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  31.84 
 
 		 580 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  28.77 
 
 		 570 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  29.58 
 
 		 571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 573 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  31.34 
 
 		 555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 571 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  31.36 
 
 		 579 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.09 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  28.29 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  29.88 
 
 		 594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  30.28 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  31.36 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  28.95 
 
 		 591 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  27.52 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  27.52 
 
 		 578 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  28.62 
 
 		 573 aa  230  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  29.29 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.66 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  31.14 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  29.7 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  29.44 
 
 		 578 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  29.44 
 
 		 578 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  27.32 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  28.62 
 
 		 577 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  28.64 
 
 		 578 aa  218  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  28.62 
 
 		 577 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  28.62 
 
 		 577 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  28.62 
 
 		 577 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  29.78 
 
 		 618 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  28.62 
 
 		 577 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  28.27 
 
 		 617 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  28.27 
 
 		 617 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 617 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  29.65 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  28.53 
 
 		 612 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  27.91 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  27.91 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  27.91 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  27.91 
 
 		 577 aa  210  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  26.04 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  28.74 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  27.91 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  27.57 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  28.74 
 
 		 591 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  27.91 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 577 aa  207  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  27.39 
 
 		 636 aa  206  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  28.21 
 
 		 617 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  28.53 
 
 		 621 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  26.94 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  27.72 
 
 		 577 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  28.76 
 
 		 612 aa  200  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 601 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  28.26 
 
 		 629 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  28.62 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.78 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  27.62 
 
 		 604 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 595 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  27.45 
 
 		 595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  27.71 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  28.09 
 
 		 604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 604 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 604 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  27.87 
 
 		 605 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  27.87 
 
 		 605 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.97 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 609 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  27.73 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  27.95 
 
 		 571 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 612 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.69 
 
 		 591 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  27.89 
 
 		 573 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  27.89 
 
 		 573 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  27.89 
 
 		 573 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 589 aa  173  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  25.67 
 
 		 562 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 618 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>