More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2384 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  100 
 
 		 589 aa  1187    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  84.03 
 
 		 595 aa  1018    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  56.94 
 
 		 612 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  86.37 
 
 		 595 aa  1015    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  52.77 
 
 		 696 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  48.42 
 
 		 611 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  48.6 
 
 		 611 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  48.25 
 
 		 604 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 605 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  48.24 
 
 		 605 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  47.79 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 605 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  48.2 
 
 		 611 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  48.34 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  48.16 
 
 		 605 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  47.64 
 
 		 682 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  48.57 
 
 		 604 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  48.39 
 
 		 604 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  48.39 
 
 		 604 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  47.12 
 
 		 611 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  41.21 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  37.91 
 
 		 585 aa  339  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  35.07 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  37.21 
 
 		 559 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  33.95 
 
 		 601 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  33.91 
 
 		 629 aa  282  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  32.66 
 
 		 648 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  31.97 
 
 		 665 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  31.06 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  31.05 
 
 		 643 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  33.16 
 
 		 634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  31.69 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  30.34 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 640 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  31.78 
 
 		 646 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  27.38 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.52 
 
 		 607 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.8 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.24 
 
 		 601 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  28.51 
 
 		 609 aa  170  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  28.52 
 
 		 598 aa  170  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.53 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.45 
 
 		 582 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.07 
 
 		 574 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.91 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.82 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  26.36 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  26.72 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.19 
 
 		 579 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.55 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  28.51 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  28.51 
 
 		 618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.92 
 
 		 596 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  25.19 
 
 		 570 aa  146  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  26.73 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  26.73 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  24.62 
 
 		 570 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  23.65 
 
 		 578 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  28.16 
 
 		 578 aa  140  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.97 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  26.16 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 577 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  26.16 
 
 		 577 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  23.14 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  25.99 
 
 		 577 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 578 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  27.96 
 
 		 578 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  26.07 
 
 		 577 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  26.07 
 
 		 577 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  26.07 
 
 		 577 aa  133  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  26.07 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  26.07 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  26.07 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  26.07 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  25.9 
 
 		 577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  25.86 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  24.63 
 
 		 636 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  23.87 
 
 		 558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  27.21 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  25.9 
 
 		 577 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  23.17 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 594 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  26.77 
 
 		 571 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  23.38 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  23.6 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  23.83 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 577 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>