257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4470 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  55.13 
 
 		 636 aa  686    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  100 
 
 		 643 aa  1289    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  55.81 
 
 		 634 aa  673    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  57.28 
 
 		 629 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  55.66 
 
 		 634 aa  670    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  50.68 
 
 		 640 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  51.13 
 
 		 621 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  50.08 
 
 		 665 aa  544  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  47.9 
 
 		 651 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  36.55 
 
 		 648 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  34 
 
 		 646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  32.3 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  32.53 
 
 		 611 aa  277  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  31.34 
 
 		 604 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  31.61 
 
 		 605 aa  273  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  31.43 
 
 		 605 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  30.6 
 
 		 605 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  31.26 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  31.43 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  31.43 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  31.43 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  31.43 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  32.48 
 
 		 591 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  30.2 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  33.5 
 
 		 612 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  30.62 
 
 		 682 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  31.15 
 
 		 595 aa  260  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  31.74 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  31.05 
 
 		 589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  34.08 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  30.61 
 
 		 595 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  30.62 
 
 		 696 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  32.03 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  30.58 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  30.76 
 
 		 559 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.28 
 
 		 573 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  28.88 
 
 		 583 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  28.39 
 
 		 580 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  27.62 
 
 		 582 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  26.19 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 583 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.89 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.26 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  26.57 
 
 		 588 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  28.6 
 
 		 575 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  24.4 
 
 		 603 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.95 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 558 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.91 
 
 		 601 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 597 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.64 
 
 		 607 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  25.17 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.13 
 
 		 570 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 591 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 636 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 593 aa  124  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.23 
 
 		 571 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  23.87 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 617 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 591 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  23.66 
 
 		 591 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  24.7 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  23.79 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.29 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 573 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.13 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.58 
 
 		 576 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.58 
 
 		 618 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  22.74 
 
 		 608 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  23.38 
 
 		 612 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  23.43 
 
 		 578 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  23.43 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  38.69 
 
 		 579 aa  97.4  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  32.82 
 
 		 609 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.72 
 
 		 610 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  35.9 
 
 		 596 aa  93.2  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  38.57 
 
 		 574 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  36.81 
 
 		 582 aa  91.3  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  38.1 
 
 		 611 aa  90.5  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  38.71 
 
 		 612 aa  90.5  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  28.97 
 
 		 578 aa  88.6  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  27.38 
 
 		 1126 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1045 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 627 aa  87.8  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>