270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2772 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  53.54 
 
 		 589 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  73.69 
 
 		 612 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  100 
 
 		 696 aa  1419    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  52.73 
 
 		 595 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  52.61 
 
 		 595 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  45.04 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 605 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  45.33 
 
 		 605 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  45.16 
 
 		 605 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  43.8 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  44.68 
 
 		 605 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  44.13 
 
 		 682 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  43.66 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  43.2 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  44.52 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  43.51 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  44.52 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  44.35 
 
 		 604 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  42.33 
 
 		 611 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  37.73 
 
 		 559 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  35.61 
 
 		 585 aa  340  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  35.98 
 
 		 585 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  32.55 
 
 		 618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  30.34 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  30.31 
 
 		 665 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  30.54 
 
 		 648 aa  256  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  30.62 
 
 		 643 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  30.87 
 
 		 636 aa  251  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  29.76 
 
 		 634 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  29.43 
 
 		 621 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  29.17 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  26.99 
 
 		 588 aa  207  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  28.36 
 
 		 579 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  28.18 
 
 		 579 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  27 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 555 aa  183  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.33 
 
 		 573 aa  180  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.65 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  25.89 
 
 		 607 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.41 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  26.47 
 
 		 593 aa  177  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  30.02 
 
 		 611 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  27.6 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.86 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 580 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 603 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 583 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.28 
 
 		 570 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  25.83 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  26.8 
 
 		 573 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 583 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25.91 
 
 		 575 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 609 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  26.03 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 597 aa  156  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 601 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 596 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  25.91 
 
 		 608 aa  153  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.79 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  26.75 
 
 		 582 aa  149  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  23.89 
 
 		 629 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 575 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  24.07 
 
 		 612 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25 
 
 		 576 aa  144  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25 
 
 		 618 aa  144  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  27.03 
 
 		 578 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 613 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  26.25 
 
 		 636 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  24.38 
 
 		 609 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  26.87 
 
 		 578 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  26.87 
 
 		 578 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 591 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  23.63 
 
 		 579 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 621 aa  134  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 617 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 617 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 571 aa  132  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.96 
 
 		 571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.92 
 
 		 612 aa  130  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  25.32 
 
 		 577 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  25.32 
 
 		 577 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  25.32 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  25.32 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  22.91 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  25.32 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>