More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1658 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  55.02 
 
 
634 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  54.05 
 
 
636 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  55.02 
 
 
634 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  100 
 
 
640 aa  1296    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  50.68 
 
 
643 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  56.31 
 
 
629 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  49.08 
 
 
665 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  47.75 
 
 
651 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  47.13 
 
 
621 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  32.4 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  32.37 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  32.2 
 
 
604 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  32.2 
 
 
604 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  32.2 
 
 
604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  32.03 
 
 
604 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  32.37 
 
 
611 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  31.1 
 
 
648 aa  273  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  32.17 
 
 
605 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  32.5 
 
 
612 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  31.69 
 
 
571 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  31.69 
 
 
605 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  31.69 
 
 
605 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  31.53 
 
 
573 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  31.53 
 
 
573 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  31.53 
 
 
573 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  32.76 
 
 
611 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  31.53 
 
 
605 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  30.88 
 
 
595 aa  260  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  31.76 
 
 
601 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  31.69 
 
 
591 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  31.33 
 
 
696 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  30.44 
 
 
595 aa  257  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  30.81 
 
 
682 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  31.39 
 
 
611 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  30.22 
 
 
589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  31.82 
 
 
585 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  30.13 
 
 
559 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  31.03 
 
 
585 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  28.03 
 
 
618 aa  200  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.47 
 
 
573 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.04 
 
 
588 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.59 
 
 
607 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  25.74 
 
 
609 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.09 
 
 
603 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  24.92 
 
 
596 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.83 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.78 
 
 
609 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  24.18 
 
 
601 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.8 
 
 
597 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  24.21 
 
 
618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  23.34 
 
 
593 aa  122  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  24.37 
 
 
617 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  24.17 
 
 
591 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  24.21 
 
 
617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  24.65 
 
 
578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  24.21 
 
 
617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  24.65 
 
 
578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  24.21 
 
 
591 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  24.37 
 
 
617 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.7 
 
 
598 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  24.65 
 
 
578 aa  120  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  26.98 
 
 
573 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  22.33 
 
 
575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  25.66 
 
 
570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  24.26 
 
 
573 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  24.58 
 
 
584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.73 
 
 
571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  24.68 
 
 
579 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.55 
 
 
612 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  23.75 
 
 
578 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23 
 
 
618 aa  107  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  22.77 
 
 
576 aa  107  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  22.81 
 
 
629 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  23.58 
 
 
578 aa  106  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  27.08 
 
 
607 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  22.46 
 
 
612 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  25.28 
 
 
622 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  26.95 
 
 
627 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  26.9 
 
 
607 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  42.14 
 
 
582 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
671 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  28.46 
 
 
1045 aa  97.4  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  24.79 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  24.79 
 
 
639 aa  97.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  28.46 
 
 
1126 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  25 
 
 
622 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
768 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
769 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
768 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
769 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
768 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
768 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  31.84 
 
 
596 aa  94  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
769 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  37.04 
 
 
555 aa  93.6  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 
768 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  40 
 
 
558 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  40.15 
 
 
570 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  37.41 
 
 
611 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>