More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2444 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  79.57 
 
 		 605 aa  994    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  79.57 
 
 		 605 aa  992    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  83.33 
 
 		 571 aa  991    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  100 
 
 		 604 aa  1231    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  83.25 
 
 		 573 aa  994    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  94.7 
 
 		 604 aa  1161    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  79.57 
 
 		 605 aa  994    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  82.7 
 
 		 682 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  83.25 
 
 		 573 aa  994    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  83.25 
 
 		 573 aa  994    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  90.91 
 
 		 605 aa  1113    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  77.12 
 
 		 611 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  91 
 
 		 611 aa  1126    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  99.5 
 
 		 604 aa  1226    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  78.38 
 
 		 611 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  75.76 
 
 		 591 aa  934    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  91 
 
 		 611 aa  1124    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  99.5 
 
 		 604 aa  1226    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  48.06 
 
 		 589 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  48.76 
 
 		 595 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  48.94 
 
 		 595 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  45.93 
 
 		 612 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  43.85 
 
 		 696 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  37.18 
 
 		 585 aa  342  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  35.42 
 
 		 585 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  33.87 
 
 		 559 aa  310  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  32.74 
 
 		 601 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  32.79 
 
 		 618 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  34.72 
 
 		 648 aa  289  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  32.41 
 
 		 629 aa  287  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  31.86 
 
 		 636 aa  283  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  32.2 
 
 		 640 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  30.85 
 
 		 651 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  32.01 
 
 		 665 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 643 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  30.88 
 
 		 634 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  31.95 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  30.7 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  30.32 
 
 		 646 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  29.28 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  27.66 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  27.64 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.99 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 609 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  28.49 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.75 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.4 
 
 		 607 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.34 
 
 		 583 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 596 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.07 
 
 		 603 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  26.92 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.34 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  26.41 
 
 		 555 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.74 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.44 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.42 
 
 		 584 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.36 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.05 
 
 		 574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 578 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.31 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  28.52 
 
 		 577 aa  154  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  28.25 
 
 		 578 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 578 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  27.34 
 
 		 579 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  28.6 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  28.79 
 
 		 577 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  28.6 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  28.79 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.8 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  28.41 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.58 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.03 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  27.74 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  28.36 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  27.55 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  25.19 
 
 		 578 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  27.55 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  27.55 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  27.55 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  27.55 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.11 
 
 		 582 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  27.55 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 591 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  27.36 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  27.88 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 594 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 636 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  26.3 
 
 		 617 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  24.66 
 
 		 588 aa  138  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  22.89 
 
 		 575 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  25.59 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>