More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2436 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  61.69 
 
 
612 aa  792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  65.51 
 
 
621 aa  847    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  67.06 
 
 
618 aa  842    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  66.33 
 
 
617 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  66.67 
 
 
617 aa  847    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  66.67 
 
 
617 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  100 
 
 
608 aa  1253    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  60.2 
 
 
613 aa  776    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  66.5 
 
 
617 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  67.57 
 
 
591 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  67.23 
 
 
591 aa  854    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  69.09 
 
 
617 aa  902    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  62.18 
 
 
596 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  65.07 
 
 
636 aa  858    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  67.57 
 
 
591 aa  851    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  36.59 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  35.58 
 
 
558 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  36.72 
 
 
573 aa  349  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  33.39 
 
 
570 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  32.89 
 
 
570 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  32.82 
 
 
582 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  33.99 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  34.43 
 
 
575 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  32.41 
 
 
577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  32.35 
 
 
577 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  32.35 
 
 
577 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  32.35 
 
 
577 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  32.35 
 
 
577 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  32.35 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  32.35 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  31.27 
 
 
591 aa  303  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  32.35 
 
 
577 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  32.35 
 
 
577 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  32.18 
 
 
577 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  32.18 
 
 
577 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  32.18 
 
 
577 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  32.18 
 
 
577 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  32.18 
 
 
577 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  32.25 
 
 
594 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  32.19 
 
 
577 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  31.77 
 
 
612 aa  296  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  31.53 
 
 
573 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  32.32 
 
 
596 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  32.66 
 
 
611 aa  293  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  31.87 
 
 
578 aa  293  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  32.32 
 
 
582 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  32.63 
 
 
579 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32.79 
 
 
574 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  32.35 
 
 
574 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  33.17 
 
 
583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  31.98 
 
 
579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  31.93 
 
 
571 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  33 
 
 
555 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  31.59 
 
 
571 aa  283  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  31.93 
 
 
578 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  32.34 
 
 
583 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  33 
 
 
583 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  32.67 
 
 
580 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  31.2 
 
 
575 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  31.91 
 
 
575 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  31.77 
 
 
578 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  31.77 
 
 
578 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  30.06 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  29.55 
 
 
588 aa  260  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  28.14 
 
 
588 aa  230  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  30.34 
 
 
607 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  28.88 
 
 
598 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  29.09 
 
 
603 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  29.65 
 
 
593 aa  207  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  28.88 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  26.75 
 
 
584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.27 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  24.68 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.81 
 
 
609 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  23.91 
 
 
578 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  25.04 
 
 
562 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  23.91 
 
 
578 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.63 
 
 
618 aa  177  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.77 
 
 
576 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  25.12 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  24.73 
 
 
612 aa  172  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  24.37 
 
 
629 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  26.64 
 
 
612 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  25.21 
 
 
696 aa  153  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
571 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
605 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
605 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
573 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
573 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  24.5 
 
 
573 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  24.14 
 
 
682 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  25.62 
 
 
611 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  24.48 
 
 
604 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  24.32 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  25.32 
 
 
604 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  25.32 
 
 
604 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  25.32 
 
 
604 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  24.33 
 
 
611 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.27 
 
 
611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.27 
 
 
611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>