More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0260 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  100 
 
 		 579 aa  1188    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  37.59 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  38.41 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  36.14 
 
 		 612 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  36.54 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  35.41 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  38.57 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  36.77 
 
 		 582 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  37.14 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  35.09 
 
 		 570 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  34.56 
 
 		 570 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  35.17 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  35.08 
 
 		 582 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  34.78 
 
 		 578 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  36.28 
 
 		 577 aa  339  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  36.28 
 
 		 577 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  36.28 
 
 		 577 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  36.28 
 
 		 577 aa  339  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  36.28 
 
 		 577 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  35.48 
 
 		 577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  36.11 
 
 		 577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  35.48 
 
 		 577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  36.11 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  35.48 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  35.48 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  35.3 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  36.11 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  34.15 
 
 		 571 aa  337  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  35.94 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  36.11 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  35.53 
 
 		 578 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  35.53 
 
 		 578 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  35.53 
 
 		 578 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  33.44 
 
 		 611 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  33.85 
 
 		 591 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  34.49 
 
 		 594 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  35.64 
 
 		 583 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  35.45 
 
 		 583 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  35.62 
 
 		 580 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  35.48 
 
 		 575 aa  317  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  35.45 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  35.83 
 
 		 555 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  35.19 
 
 		 574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  35.03 
 
 		 575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  35.09 
 
 		 583 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  31.57 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  31.02 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  31.41 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  32.12 
 
 		 573 aa  278  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  31.69 
 
 		 636 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  31.59 
 
 		 596 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  32.14 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  31.88 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 591 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  31.27 
 
 		 591 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  31.44 
 
 		 591 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  30.12 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  30.86 
 
 		 617 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  30.86 
 
 		 617 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 621 aa  250  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  30.1 
 
 		 609 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  30.69 
 
 		 617 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  30.69 
 
 		 617 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  30.53 
 
 		 617 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  31.48 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  30.47 
 
 		 593 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  28.95 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  30.22 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  29.53 
 
 		 597 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  27.63 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  27.42 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.76 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 603 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  28.96 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  26.84 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  25.65 
 
 		 562 aa  174  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  25.65 
 
 		 562 aa  173  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 629 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  25.05 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.41 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.41 
 
 		 618 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1045 aa  159  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  33.14 
 
 		 1126 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 1113 aa  144  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.11 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  28.51 
 
 		 682 aa  138  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  28.07 
 
 		 605 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  27.75 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  27.75 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  28.07 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  27.75 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  27.75 
 
 		 571 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  25 
 
 		 559 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  23.79 
 
 		 696 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  26.79 
 
 		 611 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  27.63 
 
 		 605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 595 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>