More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3485 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  74.4 
 
 
605 aa  904    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  74.4 
 
 
605 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  74.83 
 
 
571 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  77.46 
 
 
611 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  75.04 
 
 
604 aa  908    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  74.4 
 
 
605 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  92.96 
 
 
611 aa  1159    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  73.63 
 
 
682 aa  907    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  76.69 
 
 
604 aa  909    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  76.4 
 
 
573 aa  902    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  76.4 
 
 
573 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  76.4 
 
 
573 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1248    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  80.58 
 
 
591 aa  983    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  76.33 
 
 
604 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  77.64 
 
 
611 aa  913    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  76.33 
 
 
604 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  77.3 
 
 
605 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  47.23 
 
 
589 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  47.15 
 
 
595 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  45.98 
 
 
595 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  44.33 
 
 
612 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  43.36 
 
 
696 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  37.77 
 
 
585 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  35.19 
 
 
585 aa  323  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  33.98 
 
 
559 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  31.42 
 
 
601 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  32.07 
 
 
618 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  31.54 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  32.3 
 
 
643 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  32.01 
 
 
636 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  33.97 
 
 
648 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  31.9 
 
 
634 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  31.73 
 
 
634 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  30.32 
 
 
665 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  31.1 
 
 
640 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  29.3 
 
 
651 aa  243  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  30.58 
 
 
621 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  29.05 
 
 
646 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  28.07 
 
 
573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.39 
 
 
588 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.84 
 
 
575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.39 
 
 
607 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.44 
 
 
596 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.04 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  27.29 
 
 
582 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  27.15 
 
 
593 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.24 
 
 
576 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.24 
 
 
618 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  26.67 
 
 
555 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.3 
 
 
603 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.89 
 
 
583 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26.23 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.53 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.04 
 
 
580 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  26.04 
 
 
583 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  26.92 
 
 
611 aa  163  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.94 
 
 
558 aa  160  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.3 
 
 
574 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.61 
 
 
609 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.96 
 
 
574 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  26.05 
 
 
594 aa  153  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.95 
 
 
584 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.77 
 
 
570 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  25.51 
 
 
577 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  23.93 
 
 
601 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.63 
 
 
582 aa  146  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  26.93 
 
 
588 aa  146  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  26.77 
 
 
573 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.48 
 
 
597 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  24.05 
 
 
575 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.88 
 
 
579 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.08 
 
 
579 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  25.8 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.67 
 
 
570 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  24.47 
 
 
573 aa  140  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  26.3 
 
 
591 aa  140  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  25.46 
 
 
578 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  25.13 
 
 
577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.96 
 
 
577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.96 
 
 
577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.96 
 
 
577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.96 
 
 
577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  25.46 
 
 
578 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  25.59 
 
 
577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  25.59 
 
 
577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  24.33 
 
 
608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  25.52 
 
 
578 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 
577 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  25.42 
 
 
577 aa  137  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 
577 aa  137  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  25.42 
 
 
577 aa  137  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  25.42 
 
 
577 aa  137  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  25.7 
 
 
577 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  25.25 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.74 
 
 
612 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.8 
 
 
571 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  26.79 
 
 
579 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  24.37 
 
 
588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>