More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  67.35 
 
 
583 aa  814    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  61.72 
 
 
555 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  68.06 
 
 
574 aa  824    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  66.84 
 
 
580 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  68.4 
 
 
574 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  67.01 
 
 
583 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  68.97 
 
 
575 aa  832    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  67.69 
 
 
583 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  67.72 
 
 
575 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1178    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  97.41 
 
 
579 aa  1132    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  46.69 
 
 
582 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  42.52 
 
 
558 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  40.71 
 
 
573 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  36.49 
 
 
573 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  37.79 
 
 
573 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  37.14 
 
 
579 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  37.24 
 
 
582 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  36.54 
 
 
570 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  34.96 
 
 
588 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  34.5 
 
 
570 aa  343  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  37.4 
 
 
596 aa  343  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  34.6 
 
 
577 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  34.6 
 
 
577 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  34.6 
 
 
577 aa  331  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  34.6 
 
 
577 aa  331  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  34.6 
 
 
577 aa  330  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  34.6 
 
 
577 aa  329  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  34.43 
 
 
577 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  34.6 
 
 
577 aa  329  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  33.67 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  34.36 
 
 
578 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  34.43 
 
 
577 aa  327  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  31.45 
 
 
575 aa  326  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  33.45 
 
 
594 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  33.55 
 
 
617 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  33.55 
 
 
617 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
617 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
577 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  33.33 
 
 
577 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
617 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  33.33 
 
 
577 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
577 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  33.33 
 
 
577 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  33.04 
 
 
571 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  33.04 
 
 
571 aa  317  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  33.51 
 
 
578 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  33.68 
 
 
577 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  33.33 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  33.89 
 
 
596 aa  312  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  30.8 
 
 
588 aa  310  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  33.56 
 
 
618 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  33.17 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  33.9 
 
 
612 aa  306  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  32.94 
 
 
591 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  33.11 
 
 
591 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  32.61 
 
 
591 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  34.36 
 
 
612 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  32.63 
 
 
608 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  33.11 
 
 
611 aa  300  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  33.01 
 
 
636 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  34.1 
 
 
613 aa  290  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  32.63 
 
 
617 aa  276  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  32.14 
 
 
593 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  33.15 
 
 
607 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  32.45 
 
 
609 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  30.63 
 
 
609 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  31.46 
 
 
603 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  31.4 
 
 
597 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  31.78 
 
 
601 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  30.59 
 
 
584 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  28.92 
 
 
598 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  25.6 
 
 
591 aa  222  1.9999999999999999e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  28.44 
 
 
578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  27.35 
 
 
578 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  27.22 
 
 
612 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  29.46 
 
 
562 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  26.87 
 
 
629 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  29.46 
 
 
562 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.59 
 
 
576 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.59 
 
 
618 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  27.76 
 
 
696 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  33.91 
 
 
1045 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  33.91 
 
 
1126 aa  188  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  29.45 
 
 
585 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  27.57 
 
 
612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  28.47 
 
 
585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  27.62 
 
 
601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  32.09 
 
 
1113 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  28.46 
 
 
559 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  27.55 
 
 
618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  24.92 
 
 
682 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  28.67 
 
 
646 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  29.17 
 
 
648 aa  160  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.38 
 
 
571 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.38 
 
 
605 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.38 
 
 
605 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  27.83 
 
 
621 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  26.38 
 
 
573 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>