More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2360 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  54.05 
 
 		 640 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  55.74 
 
 		 643 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  62.74 
 
 		 629 aa  777    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  60.6 
 
 		 634 aa  727    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  60.44 
 
 		 634 aa  724    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  100 
 
 		 636 aa  1272    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  51.03 
 
 		 621 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  48.22 
 
 		 665 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  47.38 
 
 		 651 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  36.24 
 
 		 646 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  35.39 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  32.03 
 
 		 604 aa  286  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  32.43 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  32.1 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  32.1 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  31.59 
 
 		 611 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  32.1 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  31.59 
 
 		 611 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  33.01 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 573 aa  281  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 573 aa  281  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 573 aa  281  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 605 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 605 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 		 605 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  31.85 
 
 		 611 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  31.85 
 
 		 611 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  32.47 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  32.26 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  32.44 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  31.54 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 612 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 595 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  31.02 
 
 		 696 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  31.95 
 
 		 589 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  32.72 
 
 		 618 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  33.78 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  33.28 
 
 		 585 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  32.15 
 
 		 559 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.91 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26 
 
 		 596 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 617 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  27.55 
 
 		 579 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 617 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  25.04 
 
 		 618 aa  142  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.86 
 
 		 588 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  25.12 
 
 		 591 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.22 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 591 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 603 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 591 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.31 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  25.2 
 
 		 621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 575 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.63 
 
 		 570 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 580 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.44 
 
 		 570 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.96 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.4 
 
 		 601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  25 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.39 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  24.21 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  24.91 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 583 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  24.33 
 
 		 629 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  26.5 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.42 
 
 		 574 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  24.55 
 
 		 612 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 609 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  21.92 
 
 		 575 aa  124  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.62 
 
 		 582 aa  123  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  25.77 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  25.77 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 591 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  23.8 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  24.69 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.6 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  24.25 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 636 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  24.51 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.97 
 
 		 576 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.97 
 
 		 618 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 598 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  24.2 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  24.49 
 
 		 588 aa  107  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 627 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  24.2 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  23.36 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  27.07 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  22.26 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  24.68 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  21.95 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>