More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6386 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  66.72 
 
 		 661 aa  837    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  67.67 
 
 		 661 aa  828    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  83.31 
 
 		 665 aa  1056    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  67.49 
 
 		 661 aa  845    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  100 
 
 		 663 aa  1267    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  66.4 
 
 		 652 aa  784    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  45.58 
 
 		 677 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  43.38 
 
 		 674 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  40.12 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  41.93 
 
 		 653 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  34.9 
 
 		 671 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  34.48 
 
 		 643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  35.09 
 
 		 639 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  34.93 
 
 		 639 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  35.26 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  34.77 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  35.29 
 
 		 620 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 637 aa  301  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.66 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  38.38 
 
 		 776 aa  278  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  34.33 
 
 		 615 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  30.07 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 702 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  32.46 
 
 		 789 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  32.03 
 
 		 632 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  32.47 
 
 		 647 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  31.35 
 
 		 627 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.85 
 
 		 627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  28.2 
 
 		 613 aa  216  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  29.77 
 
 		 593 aa  210  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.15 
 
 		 588 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  30.22 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 607 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  30.03 
 
 		 607 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.98 
 
 		 670 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.74 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.24 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.6 
 
 		 610 aa  184  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 779 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 709 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.5 
 
 		 610 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  27.88 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26 
 
 		 582 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.65 
 
 		 576 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.65 
 
 		 618 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.59 
 
 		 607 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  29.05 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 580 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  27.4 
 
 		 583 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  27.26 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  29.45 
 
 		 609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.21 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.07 
 
 		 574 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  28.21 
 
 		 579 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 597 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.29 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 820 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.88 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 598 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.18 
 
 		 793 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.06 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 806 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.18 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.75 
 
 		 601 aa  107  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  29.09 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.65 
 
 		 848 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 770 aa  104  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  28.44 
 
 		 596 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.35 
 
 		 808 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.71 
 
 		 585 aa  101  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.64 
 
 		 612 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.44 
 
 		 752 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  34.02 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  28.63 
 
 		 677 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  28.63 
 
 		 677 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  37.71 
 
 		 555 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.44 
 
 		 584 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 702 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  25.27 
 
 		 629 aa  98.6  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  27.62 
 
 		 573 aa  97.8  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.81 
 
 		 920 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 760 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  28.1 
 
 		 578 aa  95.1  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.2 
 
 		 802 aa  94.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.94 
 
 		 751 aa  94  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.45 
 
 		 605 aa  93.6  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  34.51 
 
 		 835 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 673 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  25.14 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 593 aa  93.6  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.45 
 
 		 765 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 571 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.31 
 
 		 892 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  32.65 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.03 
 
 		 750 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  32.93 
 
 		 611 aa  90.5  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  26.48 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  25.59 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>