More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1129 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  100 
 
 		 776 aa  1546    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  54.79 
 
 		 789 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  42.26 
 
 		 702 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  41.2 
 
 		 615 aa  290  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  38.38 
 
 		 663 aa  288  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  38.76 
 
 		 632 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  35.46 
 
 		 665 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  34.36 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  34.56 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  34.15 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  36.93 
 
 		 653 aa  250  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  35.86 
 
 		 677 aa  246  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  34.82 
 
 		 652 aa  245  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  35.63 
 
 		 595 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  33.78 
 
 		 674 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  33.26 
 
 		 588 aa  230  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  33.91 
 
 		 653 aa  227  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  33.76 
 
 		 643 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  34.54 
 
 		 622 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  32.14 
 
 		 647 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  35.33 
 
 		 637 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  33.69 
 
 		 622 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  34.33 
 
 		 639 aa  211  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  34.12 
 
 		 639 aa  210  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  33.91 
 
 		 670 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  35.05 
 
 		 620 aa  207  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  30.23 
 
 		 613 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  29.11 
 
 		 653 aa  203  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 671 aa  201  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  31.65 
 
 		 594 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  34.16 
 
 		 779 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  34.15 
 
 		 709 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.89 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  32.27 
 
 		 593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  31.63 
 
 		 633 aa  183  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 627 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.72 
 
 		 571 aa  171  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  31.87 
 
 		 607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  31.66 
 
 		 607 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 627 aa  160  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 610 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  29.12 
 
 		 598 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.74 
 
 		 575 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  28.47 
 
 		 585 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.19 
 
 		 607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.82 
 
 		 579 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.94 
 
 		 598 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.04 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  26.09 
 
 		 612 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  26.07 
 
 		 579 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 629 aa  108  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  27.22 
 
 		 559 aa  108  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.93 
 
 		 574 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  27.82 
 
 		 603 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.17 
 
 		 580 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.14 
 
 		 609 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 583 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.83 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.69 
 
 		 835 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.12 
 
 		 582 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 555 aa  99.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.84 
 
 		 573 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.27 
 
 		 576 aa  97.8  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  22.94 
 
 		 578 aa  96.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.45 
 
 		 618 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  27.85 
 
 		 677 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 677 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  22.94 
 
 		 578 aa  95.9  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  28.1 
 
 		 657 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.83 
 
 		 597 aa  95.1  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  29.33 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 571 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 571 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 564 aa  91.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.01 
 
 		 777 aa  90.9  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  36.31 
 
 		 611 aa  91.3  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.7 
 
 		 585 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  26.43 
 
 		 596 aa  90.5  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.27 
 
 		 769 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 791 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 558 aa  88.2  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 591 aa  87.8  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.06 
 
 		 920 aa  87.4  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 594 aa  87  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  38.46 
 
 		 765 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 820 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  34.31 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  22.75 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.85 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.85 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.85 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.85 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.85 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.65 
 
 		 765 aa  84.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>