More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0703 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  100 
 
 		 702 aa  1391    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.85 
 
 		 610 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  27.05 
 
 		 677 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 677 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.2 
 
 		 657 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.33 
 
 		 769 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.15 
 
 		 769 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 768 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.68 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.62 
 
 		 770 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.62 
 
 		 767 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 769 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.11 
 
 		 768 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.93 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.69 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.69 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.55 
 
 		 768 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.69 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.9 
 
 		 760 aa  135  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.69 
 
 		 770 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 770 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  25.75 
 
 		 785 aa  129  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.53 
 
 		 781 aa  127  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  23.24 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 913 aa  126  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.6 
 
 		 844 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 781 aa  125  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.41 
 
 		 799 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 785 aa  124  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 588 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  24.26 
 
 		 673 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.69 
 
 		 763 aa  124  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.38 
 
 		 784 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  24.68 
 
 		 798 aa  123  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.24 
 
 		 784 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.78 
 
 		 761 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 787 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  23.11 
 
 		 787 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0980  surface antigen  23.97 
 
 		 802 aa  120  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00787602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.19 
 
 		 803 aa  120  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  22.34 
 
 		 791 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.08 
 
 		 780 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  22.14 
 
 		 765 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  23.3 
 
 		 777 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.93 
 
 		 765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  26.08 
 
 		 852 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 829 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.4 
 
 		 779 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.6 
 
 		 752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  24.06 
 
 		 782 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.4 
 
 		 805 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.05 
 
 		 801 aa  114  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.18 
 
 		 803 aa  114  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.86 
 
 		 752 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.18 
 
 		 781 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.38 
 
 		 809 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.47 
 
 		 848 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  25.84 
 
 		 1083 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 595 aa  112  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  24.27 
 
 		 843 aa  112  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  24.43 
 
 		 834 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  24.46 
 
 		 835 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.45 
 
 		 806 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.88 
 
 		 795 aa  111  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.88 
 
 		 795 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.88 
 
 		 795 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.71 
 
 		 750 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.49 
 
 		 790 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.58 
 
 		 787 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.31 
 
 		 854 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 857 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 845 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 843 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  26.97 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.93 
 
 		 804 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  22.03 
 
 		 804 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 844 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.62 
 
 		 841 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.36 
 
 		 784 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.82 
 
 		 864 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.82 
 
 		 854 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  24 
 
 		 803 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.42 
 
 		 765 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  23.36 
 
 		 784 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  22.1 
 
 		 564 aa  107  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.24 
 
 		 821 aa  107  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.87 
 
 		 785 aa  107  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  23.58 
 
 		 785 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.96 
 
 		 856 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  23.31 
 
 		 794 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  22.15 
 
 		 763 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.14 
 
 		 803 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.32 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>