More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2476 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  100 
 
 		 1002 aa  2074    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2804  surface antigen (D15)  28.59 
 
 		 1005 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  25.49 
 
 		 752 aa  164  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.53 
 
 		 765 aa  161  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.62 
 
 		 763 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.88 
 
 		 752 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 763 aa  156  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.35 
 
 		 848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.51 
 
 		 892 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.48 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.18 
 
 		 888 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 769 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 780 aa  144  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.02 
 
 		 913 aa  144  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  23.41 
 
 		 795 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.15 
 
 		 808 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.08 
 
 		 784 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.03 
 
 		 796 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.06 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.42 
 
 		 772 aa  140  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 802 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  21.61 
 
 		 820 aa  139  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23 
 
 		 787 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  22.53 
 
 		 786 aa  137  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.77 
 
 		 786 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  20.98 
 
 		 751 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 705 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.77 
 
 		 786 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.65 
 
 		 794 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.43 
 
 		 677 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.41 
 
 		 793 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.43 
 
 		 677 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  25.28 
 
 		 657 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.35 
 
 		 797 aa  134  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.76 
 
 		 791 aa  134  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.28 
 
 		 793 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 806 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.34 
 
 		 770 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  22.62 
 
 		 893 aa  132  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.24 
 
 		 765 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  24.35 
 
 		 765 aa  131  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.09 
 
 		 750 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.49 
 
 		 769 aa  128  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  21.72 
 
 		 781 aa  128  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.43 
 
 		 769 aa  128  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.25 
 
 		 895 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  21.5 
 
 		 790 aa  125  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.45 
 
 		 610 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 769 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.85 
 
 		 769 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 768 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 768 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  22.26 
 
 		 792 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 768 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 768 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  21.21 
 
 		 792 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 769 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 768 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 769 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.37 
 
 		 841 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.63 
 
 		 844 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  24.08 
 
 		 803 aa  122  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  21.99 
 
 		 787 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.02 
 
 		 769 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.02 
 
 		 769 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.02 
 
 		 769 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.25 
 
 		 785 aa  121  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 769 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 768 aa  121  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  21.7 
 
 		 785 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  21.86 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.28 
 
 		 770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.62 
 
 		 896 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.95 
 
 		 799 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.38 
 
 		 768 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 844 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  21.04 
 
 		 767 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  21.34 
 
 		 767 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.55 
 
 		 790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  21.3 
 
 		 758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  22.18 
 
 		 887 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.7 
 
 		 856 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  23.42 
 
 		 807 aa  115  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  24.19 
 
 		 673 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.13 
 
 		 920 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 845 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  22.59 
 
 		 779 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.68 
 
 		 806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  21.13 
 
 		 818 aa  112  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  19.77 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  22.35 
 
 		 827 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.6 
 
 		 775 aa  111  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  20.59 
 
 		 781 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.59 
 
 		 781 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.48 
 
 		 829 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.82 
 
 		 803 aa  111  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.79 
 
 		 780 aa  111  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21 
 
 		 895 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>