59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3342 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  100 
 
 		 358 aa  732    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  27.97 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  26.7 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  27.97 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  27.06 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  26.76 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  24.57 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  26.72 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  23.12 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  21.88 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  25.84 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  23.21 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  22.67 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  23.26 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  26.89 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  22.65 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  22.97 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.29 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  25.07 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.94 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  23.56 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  26.2 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  25.42 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  24.28 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.71 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  21.87 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.53 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  27.62 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  27.01 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  24.38 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  24.28 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.32 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 913 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 663 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 665 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 661 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 661 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 661 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 870 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  22.17 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  24.67 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  22.18 
 
 		 595 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  27.69 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  23.53 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  26.15 
 
 		 961 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  24.42 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  26.15 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  23.61 
 
 		 652 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  28.22 
 
 		 913 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26.5 
 
 		 653 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  28.43 
 
 		 637 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  23.84 
 
 		 407 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  32.18 
 
 		 593 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>