30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6656 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  926    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  62.93 
 
 
432 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  30.81 
 
 
444 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  29.86 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  32.58 
 
 
421 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  29.52 
 
 
407 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  33.13 
 
 
414 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  29.41 
 
 
412 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  30.97 
 
 
378 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  28.43 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  23.04 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  23.77 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.99 
 
 
390 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  23.03 
 
 
374 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  23.31 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  24.06 
 
 
374 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.94 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  24.61 
 
 
376 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  22.65 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  27.41 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  23.4 
 
 
382 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  23.66 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  22.78 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  22.33 
 
 
388 aa  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  22.76 
 
 
358 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  24.62 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  22.83 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  24.61 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  29.15 
 
 
683 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  26.71 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>