38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1799 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 395 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  80.11 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  64.84 
 
 		 383 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  37.85 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  34.59 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  33.42 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  31.34 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  24.07 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  24.32 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  26.84 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  26.29 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  29.14 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  26.16 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  23.84 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  29.82 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  25.11 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  28.65 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.95 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  25.14 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  21.73 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  28.27 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  27.57 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  28.07 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  24.32 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  22.35 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  24.58 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  21.45 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  25.28 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  26.4 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  21.86 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  22.91 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  24.62 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>