32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4990 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  778    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  38.75 
 
 
412 aa  255  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  37.99 
 
 
407 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  37.15 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  33.07 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  33.16 
 
 
421 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  28.53 
 
 
444 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  28.08 
 
 
432 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  30.97 
 
 
448 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  25.46 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  26.62 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  23.84 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  24.62 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  23.84 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  23.81 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  22.07 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  26.28 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  23.36 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  21.58 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  31.09 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  19.13 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  29.22 
 
 
683 aa  50.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  23.19 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  22.71 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  24.87 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.67 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  24.19 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  21.55 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  22.42 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  22.53 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  22.51 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  24.4 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>