54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4057 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  100 
 
 
379 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  98.42 
 
 
379 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  54.47 
 
 
378 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  48.89 
 
 
376 aa  348  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  41.8 
 
 
386 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  41.27 
 
 
374 aa  298  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  38.08 
 
 
408 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  41.19 
 
 
374 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  38.19 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  33.25 
 
 
388 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  32.65 
 
 
388 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  32.48 
 
 
388 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  33.42 
 
 
388 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  31.62 
 
 
383 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  31.36 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  30.43 
 
 
378 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  28.57 
 
 
364 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  31.81 
 
 
425 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  30.72 
 
 
359 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  27.97 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  28.24 
 
 
367 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  28.08 
 
 
358 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  25.21 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.16 
 
 
412 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  25.83 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.36 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  26.54 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.07 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  29.11 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  32.56 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  24.65 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  28.98 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  22.74 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  23.14 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  23.84 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  28.74 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  23.77 
 
 
448 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  27 
 
 
444 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  23.78 
 
 
432 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  24.73 
 
 
430 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  24.53 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  31.2 
 
 
407 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  29.65 
 
 
553 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  23.19 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  25.14 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  28.15 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  28.1 
 
 
560 aa  47.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  30.53 
 
 
913 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  24.04 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  22.71 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  23.12 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  25.65 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  26.4 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  24.65 
 
 
420 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>