26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3224 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  916    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  25.81 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3276  hypothetical protein  27.32 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4205  hypothetical protein  26.77 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000231794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0384  hypothetical protein  26.87 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  24.82 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  28.97 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.1 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  26.32 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.81 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  24.23 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  24.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  21.36 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  27.27 
 
 		 913 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  24.42 
 
 		 886 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  22.71 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  32.1 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 961 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  29.17 
 
 		 843 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  22.71 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  22.9 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  27.86 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>