21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1202 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  100 
 
 
913 aa  1864    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  64.46 
 
 
917 aa  1226    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  51.38 
 
 
925 aa  898    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  51.63 
 
 
913 aa  948    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  70.42 
 
 
913 aa  1324    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  35.78 
 
 
886 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  31.63 
 
 
1224 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  29.26 
 
 
1223 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  28.6 
 
 
855 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.94 
 
 
1263 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  28.46 
 
 
1222 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  30.12 
 
 
870 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.88 
 
 
1237 aa  317  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
1243 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  27.28 
 
 
844 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  24.12 
 
 
1228 aa  201  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.54 
 
 
414 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  23.46 
 
 
414 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  31.4 
 
 
416 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  27.27 
 
 
444 aa  45.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  28.22 
 
 
358 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>