22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0933 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  52.01 
 
 
913 aa  946    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  100 
 
 
913 aa  1859    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  51.63 
 
 
913 aa  948    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  61.08 
 
 
925 aa  1138    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  53.52 
 
 
917 aa  1007    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  34.18 
 
 
886 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  30.95 
 
 
1224 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  29.03 
 
 
855 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
1263 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
1223 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  28.77 
 
 
870 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  27.61 
 
 
1222 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.75 
 
 
1237 aa  291  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  28.08 
 
 
844 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
1243 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  26 
 
 
1228 aa  260  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  26.01 
 
 
414 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1924  surface antigen (D15)  37.39 
 
 
516 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.112702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  22.18 
 
 
374 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  28.8 
 
 
821 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  26.92 
 
 
416 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  33.7 
 
 
474 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>