193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1924 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1924  surface antigen (D15)  100 
 
 		 516 aa  1003    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.112702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0166  outer membrane protein  21.78 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.134801  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.55 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.88 
 
 		 610 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  22.67 
 
 		 798 aa  80.1  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.55 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.55 
 
 		 793 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.78 
 
 		 820 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05690  30S ribosomal protein S12  21.47 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  22.36 
 
 		 683 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.47 
 
 		 856 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.21 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  30.11 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.11 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.65 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.65 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.11 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.69 
 
 		 857 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.74 
 
 		 864 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.19 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 769 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 769 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.73 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.74 
 
 		 854 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  27 
 
 		 834 aa  67.4  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.74 
 
 		 854 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  24.39 
 
 		 844 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  22.98 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25.35 
 
 		 778 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.74 
 
 		 844 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.79 
 
 		 855 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.21 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0402  hypothetical protein  18.72 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  22.05 
 
 		 785 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.61 
 
 		 818 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.56 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.8 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  22.17 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  21.49 
 
 		 803 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 802 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  23.81 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 769 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 769 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 768 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 769 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 768 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.49 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.75 
 
 		 808 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.06 
 
 		 761 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.29 
 
 		 752 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.27 
 
 		 786 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.22 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.27 
 
 		 786 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  24.44 
 
 		 738 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.67 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.06 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.05 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  23.25 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  22.12 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.12 
 
 		 791 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  23.25 
 
 		 787 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 827 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  21.33 
 
 		 765 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  24.13 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.87 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.1 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.37 
 
 		 769 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 844 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  25.74 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.5 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  23.04 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.17 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 827 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  21.26 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.74 
 
 		 787 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.25 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.85 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.17 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.53 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.4 
 
 		 765 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  24.53 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  20.62 
 
 		 888 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  29.2 
 
 		 780 aa  57  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 		 893 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>