25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4688 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  47 
 
 		 1222 aa  835    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  40.99 
 
 		 1223 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  46.31 
 
 		 1224 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  50.17 
 
 		 870 aa  906    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  36.67 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  31.71 
 
 		 1263 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1237 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  29.3 
 
 		 1243 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  28.6 
 
 		 913 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  29.03 
 
 		 913 aa  357  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  29.53 
 
 		 917 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  29.33 
 
 		 913 aa  351  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  30.82 
 
 		 925 aa  341  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  28.42 
 
 		 886 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1228 aa  291  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  28.93 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  33.03 
 
 		 560 aa  50.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  27.54 
 
 		 414 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  24.09 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  25.08 
 
 		 474 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  21.64 
 
 		 374 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 416 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1924  surface antigen (D15)  28.87 
 
 		 516 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.112702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  23.24 
 
 		 683 aa  44.3  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>