31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2477 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  41.57 
 
 
1224 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  50.17 
 
 
855 aa  906    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  41.57 
 
 
1222 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  100 
 
 
870 aa  1789    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  37.21 
 
 
1223 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  36.42 
 
 
844 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
1263 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
1243 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.66 
 
 
1237 aa  355  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  28.77 
 
 
913 aa  350  8e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  29.9 
 
 
917 aa  346  8.999999999999999e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  30.12 
 
 
913 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  29.99 
 
 
913 aa  336  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  30.89 
 
 
925 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  26.87 
 
 
1228 aa  306  9.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  27.2 
 
 
886 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  30.77 
 
 
474 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  25.14 
 
 
414 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  28.26 
 
 
414 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  25 
 
 
416 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
430 aa  59.7  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  25.14 
 
 
427 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  27.57 
 
 
378 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  30.06 
 
 
643 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  27.46 
 
 
683 aa  51.6  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  27.43 
 
 
843 aa  50.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.15 
 
 
358 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  24.31 
 
 
358 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  27.17 
 
 
383 aa  48.9  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  25.91 
 
 
382 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  25.97 
 
 
364 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>