22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0246 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  70.42 
 
 		 913 aa  1341    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  64.53 
 
 		 917 aa  1239    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  51.16 
 
 		 925 aa  908    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  52.01 
 
 		 913 aa  962    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1858    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  34.95 
 
 		 886 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1224 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  29.26 
 
 		 1223 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  29.33 
 
 		 855 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  29.99 
 
 		 870 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.53 
 
 		 1263 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  28.68 
 
 		 1222 aa  323  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1237 aa  295  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  27.26 
 
 		 844 aa  293  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 1243 aa  286  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1228 aa  177  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 416 aa  55.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  28.57 
 
 		 358 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 414 aa  51.2  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 427 aa  45.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  28.99 
 
 		 961 aa  44.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>