47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3353 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  100 
 
 		 427 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  65.24 
 
 		 414 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  63.77 
 
 		 414 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  63.46 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  62.13 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  24.23 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  21.54 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 920 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  24.31 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 870 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  21.62 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  24.49 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.15 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  26.09 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  22.42 
 
 		 886 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  25.65 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  27.59 
 
 		 683 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  28.7 
 
 		 1222 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 577 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  21.71 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  25.17 
 
 		 913 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  21.88 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  26.59 
 
 		 1223 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  23.86 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 926 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  23.15 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  26.11 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  20.45 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  27.85 
 
 		 917 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  23.21 
 
 		 728 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.63 
 
 		 751 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  26.06 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  26.23 
 
 		 637 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  27.38 
 
 		 961 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.16 
 
 		 888 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  22.06 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  20.41 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 752 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 780 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.46 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>