77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1599 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  100 
 
 		 367 aa  725    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  28.53 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  28.99 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  28.24 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  28.98 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  27.94 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  30.19 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  27.79 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  29.56 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  29.56 
 
 		 407 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  27.94 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  31.47 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  25.37 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  27.57 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  27.46 
 
 		 553 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  26.45 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  23.98 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  26.22 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  26.07 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  26.24 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  24.86 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.02 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  26.05 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  24.63 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.37 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  24.36 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  23.98 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  23.01 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.32 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.32 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  21.99 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  29.41 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.66 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  28.48 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  23.69 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  23.59 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 595 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  37.36 
 
 		 610 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  32.28 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 961 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  28.71 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  30.92 
 
 		 950 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  37.23 
 
 		 579 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 665 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  21.43 
 
 		 444 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  22.6 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  23.46 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  26.11 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  23.21 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  28.99 
 
 		 622 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  26.42 
 
 		 762 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.85 
 
 		 770 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  26.67 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  26.67 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  34.78 
 
 		 583 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.57 
 
 		 588 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  35.87 
 
 		 575 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 560 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  29.41 
 
 		 585 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  25.64 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  25.64 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  27.86 
 
 		 582 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  25.64 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  25.64 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  33.7 
 
 		 583 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  33.7 
 
 		 583 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>