38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3971 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  839    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  47.92 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  39.37 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  38.75 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  39.42 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  37.3 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  28.83 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  30.26 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  29.41 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  25.8 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  26.61 
 
 		 364 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  25.16 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  25.16 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  25.95 
 
 		 374 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  26.71 
 
 		 386 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  25.08 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  28.67 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  23.67 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  31.98 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  25.8 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.63 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  25.53 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  26.19 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  21.33 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  25.81 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  26.78 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  25.45 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  24.91 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  26.19 
 
 		 358 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  25.89 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  26 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  27.18 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  20.84 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.62 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  25.5 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>