33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2423 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  62.93 
 
 		 448 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  31.52 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  30.25 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  28.27 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  30.26 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  26.53 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  28.42 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  28.08 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  24.17 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  21.11 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  21.63 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  25.07 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.28 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  23.78 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  21.45 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  23.24 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  22.88 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  23.46 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  23.95 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  22.8 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.95 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  28.88 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  21.46 
 
 		 358 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  24.53 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  24.12 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  23.74 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  24.42 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  27.69 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  26.67 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  21.26 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  27.15 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.1 
 
 		 627 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>