55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2510 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  100 
 
 		 376 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  53.42 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  47.62 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  47.35 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  40.62 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  40.11 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  37.43 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  38.24 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  36.84 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  30.5 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  31.96 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  31.97 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  30.42 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  29.66 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  34.67 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  30.36 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  29.71 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  29.97 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  27.25 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  26.76 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  25.37 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  27.76 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  26.42 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  27.11 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  26.53 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  26.01 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  26.82 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  25.89 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.08 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  25.14 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  25.07 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.48 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  28.29 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  29.14 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.15 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  26.88 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  29.48 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  23.31 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  23.23 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  23.82 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  24.21 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 560 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  22.19 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  25.25 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  22.14 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  23.26 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  21.83 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  22.9 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  25.58 
 
 		 588 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.92 
 
 		 751 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>