59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0541 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  88.92 
 
 		 388 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  82.22 
 
 		 382 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  87.89 
 
 		 388 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  85.31 
 
 		 388 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  75.32 
 
 		 383 aa  607  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  41.23 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  35.38 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  33.42 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  33.42 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  33.42 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  34.62 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  34.99 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  32.69 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  30.92 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  31.98 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  28.84 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  25.44 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  25.95 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  26.74 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  26.22 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  32.77 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  31.07 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  34.23 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  30.51 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  30.51 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.23 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  23.26 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  22.73 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  24.6 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3276  hypothetical protein  24.78 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  22.29 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  28.02 
 
 		 843 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  35.4 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  22.04 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  22.68 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  23.8 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  24.53 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  22.54 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  23.5 
 
 		 961 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  31.62 
 
 		 821 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.24 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  27.43 
 
 		 450 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 688 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.74 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  26.42 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  32 
 
 		 999 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  30.63 
 
 		 838 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  25.66 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  27.43 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  21.66 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>