32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1149 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  801    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  32.01 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
383 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  32.68 
 
 
421 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  31.34 
 
 
395 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  31.94 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  29.69 
 
 
379 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.31 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  21.99 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  25.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  30.99 
 
 
408 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  30.28 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  30.28 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  24.27 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  23.94 
 
 
378 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  19.75 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  25.25 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  26.78 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  24.5 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  23.27 
 
 
388 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  25.23 
 
 
388 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  21.81 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  25.44 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  28.49 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  23.04 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  24.1 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  25.6 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  25.65 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  22.33 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  24.4 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  21.66 
 
 
388 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>