65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0320 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  41.97 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  40.1 
 
 		 388 aa  282  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  38.77 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  41.55 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  40.72 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  41.23 
 
 		 388 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  38.19 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  37.47 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  39.55 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  39.33 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  40.56 
 
 		 376 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  36.89 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  34.35 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  29.82 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  29.29 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  30 
 
 		 378 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  29.67 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  29.08 
 
 		 358 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  27.08 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  26.29 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.94 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  27.05 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  30.73 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  24.93 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  25.86 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.7 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25.56 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  23.89 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  24.13 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  24.19 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  33.88 
 
 		 560 aa  66.2  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  23.03 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  21.33 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  23.64 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  23.18 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  23.27 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  23.61 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  26.15 
 
 		 595 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  19.32 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  27.17 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  23.12 
 
 		 961 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  25.93 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  22.77 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  27.23 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 637 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 821 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  28.64 
 
 		 665 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  24.63 
 
 		 661 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  25.76 
 
 		 450 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 622 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  32.19 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 843 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  20.71 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  25.54 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 661 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 661 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>