24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3752 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  100 
 
 		 1222 aa  2544    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  50.9 
 
 		 1224 aa  1263    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  47.72 
 
 		 855 aa  854    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  44.67 
 
 		 1223 aa  1087    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  42.16 
 
 		 870 aa  735    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  30.92 
 
 		 1263 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  30.93 
 
 		 1243 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  37.14 
 
 		 844 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1237 aa  538  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1228 aa  458  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  31.04 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 913 aa  356  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  31.27 
 
 		 925 aa  355  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  27.61 
 
 		 913 aa  339  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  28.97 
 
 		 913 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  28.27 
 
 		 886 aa  317  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  23.51 
 
 		 474 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 683 aa  55.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 416 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 430 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  26.01 
 
 		 414 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 560 aa  50.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  28.7 
 
 		 427 aa  47.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>