23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2814 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  47.38 
 
 		 1223 aa  1140    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  50.82 
 
 		 1222 aa  1263    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  41.57 
 
 		 870 aa  708    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 1224 aa  2516    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  32.43 
 
 		 1263 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  46.31 
 
 		 855 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  39.86 
 
 		 844 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  29.48 
 
 		 1243 aa  559  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1237 aa  515  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1228 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  31.36 
 
 		 913 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  30.95 
 
 		 913 aa  363  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  32.01 
 
 		 917 aa  360  7e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  33.07 
 
 		 925 aa  357  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  31.26 
 
 		 913 aa  353  8e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  32.17 
 
 		 886 aa  341  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  25.87 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  26.97 
 
 		 430 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  25.99 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  29.14 
 
 		 821 aa  48.5  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 416 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  25.73 
 
 		 627 aa  46.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  26.6 
 
 		 474 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>