More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2365 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 1107 aa  2270    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.13 
 
 		 765 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.71 
 
 		 752 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.05 
 
 		 769 aa  131  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  26.84 
 
 		 820 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.2 
 
 		 808 aa  125  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 763 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 		 807 aa  122  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  26.58 
 
 		 781 aa  120  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.26 
 
 		 803 aa  120  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.99 
 
 		 751 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 752 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 785 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 763 aa  118  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.8 
 
 		 802 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  27.11 
 
 		 910 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  29.04 
 
 		 905 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.13 
 
 		 806 aa  115  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.93 
 
 		 770 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.46 
 
 		 770 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 785 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  26.72 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.13 
 
 		 793 aa  113  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.19 
 
 		 767 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.13 
 
 		 793 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.4 
 
 		 763 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  25.26 
 
 		 798 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.35 
 
 		 769 aa  112  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.32 
 
 		 868 aa  111  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  26.72 
 
 		 887 aa  110  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.7 
 
 		 769 aa  108  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 		 831 aa  108  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0825  outer membrane protein  27.39 
 
 		 821 aa  107  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.860855  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.25 
 
 		 772 aa  107  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  26.77 
 
 		 758 aa  107  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.93 
 
 		 781 aa  107  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.25 
 
 		 827 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  24.81 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.25 
 
 		 777 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  25.06 
 
 		 926 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  27.54 
 
 		 820 aa  105  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  24.3 
 
 		 767 aa  104  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.93 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  24.93 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  24.93 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25.54 
 
 		 778 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 843 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.93 
 
 		 768 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 790 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.93 
 
 		 768 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 888 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.34 
 
 		 769 aa  102  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.59 
 
 		 785 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  24.64 
 
 		 769 aa  101  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  26.88 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  23.34 
 
 		 852 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  24.06 
 
 		 843 aa  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 769 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 768 aa  99.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 841 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 769 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.86 
 
 		 848 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  25.06 
 
 		 780 aa  100  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 765 aa  99.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 768 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 768 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.37 
 
 		 895 aa  99.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 766 aa  99.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 769 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 768 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 768 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.07 
 
 		 765 aa  99.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.48 
 
 		 821 aa  98.6  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 830 aa  98.6  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 794 aa  98.2  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.73 
 
 		 841 aa  97.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  23.76 
 
 		 818 aa  97.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  25.38 
 
 		 858 aa  96.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 790 aa  96.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.52 
 
 		 775 aa  97.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.88 
 
 		 836 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 845 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  25.97 
 
 		 796 aa  95.9  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.54 
 
 		 895 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.61 
 
 		 784 aa  95.9  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 765 aa  95.9  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 772 aa  95.9  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  23.26 
 
 		 834 aa  95.1  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.77 
 
 		 800 aa  95.1  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 791 aa  94.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.5 
 
 		 786 aa  94  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 		 769 aa  94.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.73 
 
 		 855 aa  94.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 760 aa  94.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.47 
 
 		 750 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.42 
 
 		 818 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 834 aa  94  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 770 aa  93.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.33 
 
 		 785 aa  93.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>