15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1629 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1629  surface antigen variable number  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432291  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  94.37 
 
 		 1349 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  91.55 
 
 		 1570 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  92.96 
 
 		 1391 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  52.11 
 
 		 568 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  52.11 
 
 		 568 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  46.48 
 
 		 595 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  45.95 
 
 		 588 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  43.24 
 
 		 608 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  42.67 
 
 		 585 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.85 
 
 		 580 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  37.18 
 
 		 595 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.5 
 
 		 639 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.5 
 
 		 584 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  35.62 
 
 		 584 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>