136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6351 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  40.48 
 
 		 3322 aa  1047    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 		 3785 aa  7339    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  68.31 
 
 		 3884 aa  4171    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  36.61 
 
 		 3526 aa  741    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.21 
 
 		 4966 aa  573  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.89 
 
 		 3028 aa  534  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.15 
 
 		 3475 aa  484  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.75 
 
 		 3480 aa  474  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.66 
 
 		 3378 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.31 
 
 		 3147 aa  471  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  30.13 
 
 		 3004 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  29.86 
 
 		 3131 aa  464  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  29.86 
 
 		 3144 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.59 
 
 		 3141 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  29.84 
 
 		 3563 aa  433  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  29.49 
 
 		 3141 aa  425  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.66 
 
 		 2600 aa  420  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  29.02 
 
 		 3443 aa  411  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  35.14 
 
 		 3301 aa  398  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.87 
 
 		 3079 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  37.16 
 
 		 3081 aa  382  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  28.42 
 
 		 5212 aa  377  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.78 
 
 		 2421 aa  374  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.16 
 
 		 3159 aa  374  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  38.91 
 
 		 1998 aa  366  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.05 
 
 		 2345 aa  357  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  32.43 
 
 		 3165 aa  354  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.78 
 
 		 3501 aa  353  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  34.33 
 
 		 3552 aa  352  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.3 
 
 		 3128 aa  349  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  31.51 
 
 		 2061 aa  346  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  29.05 
 
 		 2588 aa  342  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  28.81 
 
 		 2530 aa  339  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.4 
 
 		 2545 aa  339  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.31 
 
 		 3020 aa  338  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  31.75 
 
 		 3141 aa  335  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  34.79 
 
 		 2984 aa  326  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.57 
 
 		 3796 aa  311  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  47.52 
 
 		 3350 aa  307  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.52 
 
 		 658 aa  304  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.05 
 
 		 3602 aa  293  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.94 
 
 		 2782 aa  291  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.34 
 
 		 3967 aa  283  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  24.96 
 
 		 2758 aa  269  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  42.72 
 
 		 1571 aa  267  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  34.85 
 
 		 710 aa  263  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.43 
 
 		 2670 aa  240  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.31 
 
 		 3040 aa  230  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  44.31 
 
 		 6274 aa  226  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  36.16 
 
 		 594 aa  221  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  27.48 
 
 		 2904 aa  214  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.18 
 
 		 5981 aa  206  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.86 
 
 		 3862 aa  206  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.33 
 
 		 1730 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  26.74 
 
 		 3300 aa  203  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  28.61 
 
 		 1270 aa  200  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  39.78 
 
 		 2449 aa  199  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.28 
 
 		 428 aa  199  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.55 
 
 		 1723 aa  198  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.78 
 
 		 812 aa  197  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  41.24 
 
 		 2827 aa  188  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.75 
 
 		 923 aa  187  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  33.64 
 
 		 1719 aa  177  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.68 
 
 		 721 aa  173  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  33.64 
 
 		 2350 aa  172  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1268 aa  169  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  29.21 
 
 		 991 aa  169  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  31.12 
 
 		 2542 aa  164  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  32.29 
 
 		 2732 aa  162  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  31.29 
 
 		 2651 aa  161  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  28.81 
 
 		 763 aa  156  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  34.32 
 
 		 463 aa  144  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1052 aa  142  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1077 aa  142  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  131  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  37.67 
 
 		 2737 aa  127  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  36.97 
 
 		 1038 aa  125  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  33.58 
 
 		 1489 aa  124  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.76 
 
 		 1615 aa  124  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  34.07 
 
 		 1651 aa  123  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  31.32 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  27.02 
 
 		 2964 aa  122  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.59 
 
 		 1508 aa  122  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.73 
 
 		 846 aa  121  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  38.33 
 
 		 2691 aa  121  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  34.14 
 
 		 846 aa  120  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  29.12 
 
 		 1745 aa  120  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  38.33 
 
 		 2751 aa  119  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.82 
 
 		 1508 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  32.94 
 
 		 1841 aa  119  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  31.78 
 
 		 1618 aa  118  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.72 
 
 		 2786 aa  119  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.27 
 
 		 1508 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.07 
 
 		 847 aa  115  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.84 
 
 		 1508 aa  113  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  35.77 
 
 		 3929 aa  112  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  31.05 
 
 		 1635 aa  108  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.2 
 
 		 2847 aa  108  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  35.43 
 
 		 915 aa  108  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>