148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02477 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  32.36 
 
 		 3165 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 3322 aa  6515    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.85 
 
 		 3884 aa  1022    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  32.33 
 
 		 3131 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.01 
 
 		 3475 aa  924    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  44.77 
 
 		 1998 aa  763    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  33.87 
 
 		 3301 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.12 
 
 		 3028 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.88 
 
 		 2600 aa  931    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  32.53 
 
 		 3144 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  32.26 
 
 		 3141 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.57 
 
 		 2421 aa  697    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.63 
 
 		 2345 aa  825    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  31.71 
 
 		 3141 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  31.67 
 
 		 3141 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  71.25 
 
 		 848 aa  629  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.08 
 
 		 3378 aa  616  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.35 
 
 		 3128 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.79 
 
 		 3480 aa  594  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  30.58 
 
 		 3159 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  30.41 
 
 		 3147 aa  573  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  42.65 
 
 		 3350 aa  554  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  33.46 
 
 		 3081 aa  521  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  43.92 
 
 		 2530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  43.48 
 
 		 2588 aa  517  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50.91 
 
 		 658 aa  516  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.48 
 
 		 2545 aa  516  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.43 
 
 		 4966 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  42.54 
 
 		 915 aa  486  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  40.04 
 
 		 3526 aa  474  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  35.77 
 
 		 3501 aa  470  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.57 
 
 		 3785 aa  471  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  37.82 
 
 		 3552 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.36 
 
 		 3602 aa  462  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.78 
 
 		 3079 aa  464  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  44.08 
 
 		 710 aa  457  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  36.6 
 
 		 2984 aa  458  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.81 
 
 		 3020 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  38.57 
 
 		 3004 aa  453  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.83 
 
 		 2782 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.84 
 
 		 3862 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.5 
 
 		 6274 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.04 
 
 		 3796 aa  374  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  29.79 
 
 		 2758 aa  365  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.76 
 
 		 3790 aa  358  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  30.97 
 
 		 5212 aa  350  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  31.71 
 
 		 3563 aa  348  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  30.39 
 
 		 3443 aa  338  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.07 
 
 		 3967 aa  328  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.08 
 
 		 3040 aa  310  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  39.57 
 
 		 1571 aa  307  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  32.37 
 
 		 3300 aa  303  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  37.18 
 
 		 2061 aa  301  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.89 
 
 		 5981 aa  263  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.35 
 
 		 1730 aa  256  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  37.69 
 
 		 541 aa  253  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  39.46 
 
 		 857 aa  239  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  38.41 
 
 		 594 aa  234  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.11 
 
 		 428 aa  232  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  28.98 
 
 		 1270 aa  228  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1268 aa  226  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.02 
 
 		 2670 aa  226  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.53 
 
 		 812 aa  225  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1077 aa  212  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.76 
 
 		 1723 aa  211  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.83 
 
 		 2827 aa  207  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  38.1 
 
 		 2449 aa  208  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  32.49 
 
 		 2904 aa  197  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  24.8 
 
 		 2547 aa  194  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  34.67 
 
 		 1719 aa  186  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  24.14 
 
 		 2542 aa  184  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.25 
 
 		 923 aa  183  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  25.99 
 
 		 2732 aa  183  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  39.86 
 
 		 2350 aa  183  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  25.68 
 
 		 2651 aa  178  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  41.04 
 
 		 1038 aa  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  32.6 
 
 		 991 aa  173  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.24 
 
 		 721 aa  172  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  28.07 
 
 		 2536 aa  166  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  29.61 
 
 		 2737 aa  163  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  30.44 
 
 		 1618 aa  159  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.89 
 
 		 1615 aa  153  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  30.16 
 
 		 1635 aa  152  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.85 
 
 		 2818 aa  149  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  28.24 
 
 		 2964 aa  147  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  37.5 
 
 		 1489 aa  147  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  33.75 
 
 		 1841 aa  146  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.48 
 
 		 2786 aa  145  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  30.85 
 
 		 2691 aa  144  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  33.33 
 
 		 463 aa  143  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.49 
 
 		 2847 aa  139  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  34.36 
 
 		 716 aa  136  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1052 aa  135  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.75 
 
 		 2666 aa  135  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  32.76 
 
 		 463 aa  135  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.76 
 
 		 463 aa  135  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  33.09 
 
 		 905 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  34.12 
 
 		 3929 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  33.09 
 
 		 905 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  35.29 
 
 		 914 aa  133  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>