140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5341 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  41.2 
 
 
3501 aa  1338    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  41.53 
 
 
3552 aa  1355    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  36.96 
 
 
3081 aa  991    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.09 
 
 
3079 aa  1708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  42.96 
 
 
3131 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  32.64 
 
 
3141 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  44.81 
 
 
3147 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  48.11 
 
 
3301 aa  1811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  42.55 
 
 
2984 aa  1618    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  100 
 
 
3004 aa  5888    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.74 
 
 
3028 aa  1566    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  42.75 
 
 
3144 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  43.13 
 
 
3141 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  44.07 
 
 
3159 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.03 
 
 
2782 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  53.35 
 
 
3020 aa  2477    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  40.98 
 
 
3141 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.7 
 
 
3128 aa  593  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  45.19 
 
 
3165 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.07 
 
 
3884 aa  515  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  37.74 
 
 
3322 aa  477  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  35.71 
 
 
3526 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  50.66 
 
 
541 aa  441  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.4 
 
 
2545 aa  412  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.82 
 
 
2588 aa  411  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.8 
 
 
2530 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  52.03 
 
 
1038 aa  406  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.61 
 
 
3785 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.6 
 
 
3040 aa  383  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  32.54 
 
 
3350 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.32 
 
 
3602 aa  377  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.03 
 
 
3790 aa  367  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.46 
 
 
3796 aa  362  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.07 
 
 
3967 aa  358  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.23 
 
 
3862 aa  355  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.76 
 
 
2600 aa  349  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.02 
 
 
2345 aa  331  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  31.11 
 
 
2758 aa  330  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.86 
 
 
2421 aa  329  5e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  28.28 
 
 
3300 aa  326  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.56 
 
 
3475 aa  325  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.35 
 
 
3480 aa  319  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  30.43 
 
 
5212 aa  319  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.07 
 
 
658 aa  319  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  34.85 
 
 
3443 aa  318  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  34.57 
 
 
3563 aa  314  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.62 
 
 
3378 aa  303  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  39.94 
 
 
710 aa  301  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.55 
 
 
6274 aa  298  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  30.29 
 
 
1998 aa  285  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.82 
 
 
4966 aa  285  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.2 
 
 
2670 aa  269  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  38.65 
 
 
594 aa  248  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  33.37 
 
 
1268 aa  245  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.1 
 
 
5981 aa  226  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  35.23 
 
 
1077 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  34.72 
 
 
1052 aa  224  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.23 
 
 
1730 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  35.69 
 
 
857 aa  212  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  36.4 
 
 
763 aa  211  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.39 
 
 
2827 aa  208  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.19 
 
 
1723 aa  206  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  31.58 
 
 
2904 aa  205  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.53 
 
 
812 aa  199  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  27.33 
 
 
1270 aa  190  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  30.1 
 
 
2061 aa  187  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.15 
 
 
923 aa  184  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  34.75 
 
 
991 aa  182  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.91 
 
 
2536 aa  180  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.35 
 
 
721 aa  177  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.8 
 
 
2666 aa  172  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  35.93 
 
 
2449 aa  172  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.27 
 
 
428 aa  169  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.2 
 
 
2786 aa  168  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  36.62 
 
 
2350 aa  156  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  35.69 
 
 
1719 aa  154  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  24.04 
 
 
2732 aa  146  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  29.39 
 
 
2691 aa  146  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.14 
 
 
2818 aa  145  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  30.46 
 
 
2737 aa  144  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  30.62 
 
 
905 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  34.27 
 
 
3929 aa  145  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  30.62 
 
 
905 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  23.45 
 
 
2651 aa  145  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  30.78 
 
 
914 aa  143  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  30.22 
 
 
1841 aa  143  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  30.43 
 
 
911 aa  142  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  28.97 
 
 
2751 aa  139  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  27.08 
 
 
2547 aa  135  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.26 
 
 
2847 aa  135  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  30.09 
 
 
901 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  29.38 
 
 
898 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  33.77 
 
 
1618 aa  133  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  29.98 
 
 
893 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.22 
 
 
1508 aa  130  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  28.45 
 
 
1635 aa  130  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  32.29 
 
 
1571 aa  130  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  33.99 
 
 
1489 aa  129  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  45.56 
 
 
848 aa  127  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  21.83 
 
 
2542 aa  128  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>