110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3183 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  100 
 
 		 846 aa  1644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  95.27 
 
 		 846 aa  1531    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2933  filamentous haemagglutinin, N-terminal  55.13 
 
 		 849 aa  830    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  78.63 
 
 		 847 aa  1316    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  53.18 
 
 		 678 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  51.3 
 
 		 678 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  55.32 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  53.47 
 
 		 716 aa  290  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.71 
 
 		 681 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1420  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.67 
 
 		 671 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.850328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.72 
 
 		 2600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.72 
 
 		 2345 aa  127  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.3 
 
 		 2421 aa  125  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  30.81 
 
 		 3552 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.51 
 
 		 3159 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.84 
 
 		 3028 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.38 
 
 		 658 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  30.68 
 
 		 3501 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  27.89 
 
 		 3144 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  29.4 
 
 		 3350 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.58 
 
 		 2530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.83 
 
 		 2588 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.83 
 
 		 2545 aa  118  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  27.58 
 
 		 3131 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  28.85 
 
 		 3141 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  28.71 
 
 		 1489 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.61 
 
 		 1723 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  29.42 
 
 		 3147 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.68 
 
 		 3884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.96 
 
 		 3967 aa  112  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.22 
 
 		 3602 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  30.25 
 
 		 3165 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  34.84 
 
 		 3322 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  35.95 
 
 		 3004 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.58 
 
 		 3128 aa  111  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  31.25 
 
 		 1998 aa  110  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.44 
 
 		 2782 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.22 
 
 		 6274 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  34.74 
 
 		 3929 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.24 
 
 		 2670 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  33.77 
 
 		 1651 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.74 
 
 		 3040 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  29.59 
 
 		 2984 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.85 
 
 		 5981 aa  105  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.51 
 
 		 1730 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.89 
 
 		 3785 aa  104  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.67 
 
 		 2827 aa  104  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.08 
 
 		 3301 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.23 
 
 		 3079 aa  103  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  26.44 
 
 		 3443 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.91 
 
 		 3475 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.84 
 
 		 812 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.53 
 
 		 2666 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  29.66 
 
 		 2737 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  25.35 
 
 		 5212 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.66 
 
 		 3862 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  30.81 
 
 		 3141 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.76 
 
 		 923 aa  99.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.51 
 
 		 3020 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.11 
 
 		 3790 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  31.54 
 
 		 2758 aa  98.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  27.04 
 
 		 3141 aa  99  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.87 
 
 		 1508 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  32.22 
 
 		 1841 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.92 
 
 		 3480 aa  95.9  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.13 
 
 		 3378 aa  95.9  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.34 
 
 		 1508 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.9 
 
 		 3796 aa  94.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  25.75 
 
 		 2449 aa  94.7  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 		 428 aa  94.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.95 
 
 		 1508 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  31.15 
 
 		 594 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.94 
 
 		 721 aa  91.3  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.71 
 
 		 2536 aa  90.9  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  28.08 
 
 		 914 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  29.28 
 
 		 901 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  31.08 
 
 		 3563 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  29.47 
 
 		 1618 aa  90.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  26.58 
 
 		 3081 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  29.28 
 
 		 893 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  23.2 
 
 		 1745 aa  89.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  33.11 
 
 		 2691 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  29.3 
 
 		 1270 aa  88.6  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  30.68 
 
 		 2751 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  30.14 
 
 		 1635 aa  88.2  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  29.59 
 
 		 3526 aa  88.2  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.58 
 
 		 1508 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.13 
 
 		 2847 aa  87.8  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 905 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 905 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 898 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  28.95 
 
 		 911 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.8 
 
 		 1615 aa  84.7  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  42.96 
 
 		 4966 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.31 
 
 		 2786 aa  82  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 2818 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  30.72 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  23.64 
 
 		 1719 aa  75.5  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  32.53 
 
 		 2350 aa  75.5  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  28.57 
 
 		 1615 aa  74.3  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>