108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5443 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  61.7 
 
 
716 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
730 aa  1435    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50.35 
 
 
678 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.86 
 
 
678 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.79 
 
 
681 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.98 
 
 
847 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1420  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.91 
 
 
671 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.850328  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  55.32 
 
 
846 aa  286  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  54.45 
 
 
846 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2933  filamentous haemagglutinin, N-terminal  40.8 
 
 
849 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  32.05 
 
 
3322 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  35.58 
 
 
3159 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.89 
 
 
2600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.21 
 
 
2670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  27.75 
 
 
5212 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  28.87 
 
 
1998 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.61 
 
 
3144 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.79 
 
 
3790 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  28.78 
 
 
3141 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.21 
 
 
2827 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.41 
 
 
3501 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  29.31 
 
 
3443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.77 
 
 
812 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  34.08 
 
 
3552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.72 
 
 
1730 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  32.14 
 
 
3165 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  32.42 
 
 
3141 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  32.42 
 
 
3141 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  29.94 
 
 
3350 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  28.19 
 
 
3131 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.42 
 
 
1723 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.39 
 
 
3796 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.39 
 
 
3967 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.96 
 
 
3128 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.74 
 
 
658 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.67 
 
 
5981 aa  104  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.9 
 
 
6274 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.4 
 
 
3079 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.31 
 
 
3147 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.84 
 
 
2421 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.09 
 
 
3020 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  25.67 
 
 
3081 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  30.54 
 
 
2588 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.45 
 
 
2530 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.07 
 
 
2545 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.79 
 
 
3862 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  30.67 
 
 
3929 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.93 
 
 
2345 aa  98.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  25.47 
 
 
1489 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.94 
 
 
1508 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.03 
 
 
3040 aa  97.4  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.86 
 
 
3301 aa  97.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.92 
 
 
3028 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  29.67 
 
 
594 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.84 
 
 
1508 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.97 
 
 
3475 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.86 
 
 
3884 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.52 
 
 
2984 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.85 
 
 
1508 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  31.76 
 
 
3563 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.49 
 
 
3378 aa  94  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.49 
 
 
3480 aa  94  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.87 
 
 
1508 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  31.18 
 
 
1841 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.07 
 
 
3602 aa  94  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.7 
 
 
2782 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  27.33 
 
 
1745 aa  93.2  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.8 
 
 
923 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  27.95 
 
 
3004 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  32.07 
 
 
1651 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  29.35 
 
 
2758 aa  90.5  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  31.67 
 
 
1618 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.83 
 
 
1615 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  29.85 
 
 
1635 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.37 
 
 
4966 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33 
 
 
3785 aa  89  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  27.41 
 
 
1719 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  26.67 
 
 
2449 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  29.97 
 
 
1270 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.97 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  29.58 
 
 
3526 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.43 
 
 
721 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  27.43 
 
 
2350 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  26.18 
 
 
901 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  26.5 
 
 
893 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  26.18 
 
 
914 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  29.06 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.41 
 
 
2666 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.59 
 
 
2536 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  25.55 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  25.55 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  25.55 
 
 
898 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  25.55 
 
 
911 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.64 
 
 
2786 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  26.82 
 
 
463 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.82 
 
 
463 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  28.43 
 
 
2691 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.34 
 
 
262 aa  67  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  30.3 
 
 
2751 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.27 
 
 
2847 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>