121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0065 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 		 1723 aa  3477    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.08 
 
 		 3040 aa  293  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.82 
 
 		 3967 aa  286  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.88 
 
 		 1730 aa  280  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.53 
 
 		 3862 aa  276  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.99 
 
 		 5981 aa  268  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  42.65 
 
 		 2758 aa  257  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.48 
 
 		 3796 aa  255  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.28 
 
 		 3790 aa  254  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  41.23 
 
 		 6274 aa  244  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  41.35 
 
 		 3443 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  41.35 
 
 		 5212 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.97 
 
 		 2670 aa  238  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  34.36 
 
 		 3563 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  35.19 
 
 		 594 aa  234  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  46.18 
 
 		 2827 aa  222  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  47.24 
 
 		 3501 aa  212  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  39.76 
 
 		 3322 aa  211  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  46.85 
 
 		 3552 aa  209  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  39.19 
 
 		 3004 aa  207  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.7 
 
 		 2421 aa  205  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.68 
 
 		 2345 aa  204  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.63 
 
 		 3028 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  39.04 
 
 		 1998 aa  203  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.29 
 
 		 2782 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.37 
 
 		 2600 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  50.69 
 
 		 3884 aa  200  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.35 
 
 		 3602 aa  199  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.68 
 
 		 3475 aa  197  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  42.58 
 
 		 3159 aa  196  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.83 
 
 		 3480 aa  196  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.83 
 
 		 3378 aa  196  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.94 
 
 		 812 aa  195  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  41.37 
 
 		 3147 aa  195  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 		 428 aa  194  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.69 
 
 		 3020 aa  193  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  35.14 
 
 		 3350 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  37.85 
 
 		 3165 aa  192  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  43.48 
 
 		 3141 aa  192  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  43.48 
 
 		 3141 aa  192  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.91 
 
 		 658 aa  191  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.19 
 
 		 3128 aa  191  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.87 
 
 		 3079 aa  189  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  39.32 
 
 		 3301 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  39.74 
 
 		 3144 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.66 
 
 		 4966 aa  186  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  40.21 
 
 		 2984 aa  186  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  32.12 
 
 		 3141 aa  185  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  39.74 
 
 		 3131 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  34.38 
 
 		 2530 aa  182  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  41.94 
 
 		 2588 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.94 
 
 		 2545 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  27.94 
 
 		 2904 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.19 
 
 		 3785 aa  179  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  35.44 
 
 		 1489 aa  179  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  37.96 
 
 		 1651 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  40.52 
 
 		 3526 aa  177  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  41.35 
 
 		 1618 aa  171  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  34.85 
 
 		 3081 aa  165  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.42 
 
 		 721 aa  162  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  24.18 
 
 		 991 aa  160  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.98 
 
 		 1508 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  34.43 
 
 		 1719 aa  157  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  37.55 
 
 		 1635 aa  157  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.58 
 
 		 1508 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.57 
 
 		 1508 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  37.67 
 
 		 1270 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  34.75 
 
 		 2350 aa  154  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.35 
 
 		 1508 aa  154  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.74 
 
 		 923 aa  152  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.27 
 
 		 1615 aa  150  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  34.53 
 
 		 2449 aa  149  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  26.64 
 
 		 980 aa  148  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  35.21 
 
 		 2536 aa  144  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  28.19 
 
 		 2737 aa  127  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  31.56 
 
 		 1745 aa  125  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  31.86 
 
 		 893 aa  125  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  31.86 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  34.82 
 
 		 914 aa  123  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  34.82 
 
 		 911 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  34.82 
 
 		 905 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  34.82 
 
 		 905 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  34.82 
 
 		 898 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.08 
 
 		 2666 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  31.91 
 
 		 3929 aa  120  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.43 
 
 		 262 aa  120  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  30.29 
 
 		 463 aa  116  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.33 
 
 		 2818 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  30.6 
 
 		 716 aa  112  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  26.92 
 
 		 2651 aa  112  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  29.27 
 
 		 2751 aa  111  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  30 
 
 		 463 aa  111  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 		 463 aa  111  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  30.36 
 
 		 2691 aa  110  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  49.15 
 
 		 1841 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.82 
 
 		 846 aa  109  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.68 
 
 		 2847 aa  108  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.4 
 
 		 846 aa  108  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.42 
 
 		 730 aa  108  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.33 
 
 		 678 aa  106  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>