150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1622 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.23 
 
 
3796 aa  731    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  32.29 
 
 
3131 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  34.62 
 
 
3141 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  33.38 
 
 
3147 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.11 
 
 
3790 aa  761    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.24 
 
 
2600 aa  739    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  33.21 
 
 
3144 aa  698    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  32.63 
 
 
3141 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  33.74 
 
 
3159 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  34.69 
 
 
3141 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.59 
 
 
3967 aa  795    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.27 
 
 
2782 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  64.68 
 
 
3350 aa  2532    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  69.67 
 
 
1268 aa  1233    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  97.69 
 
 
2588 aa  4470    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.63 
 
 
3862 aa  768    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.78 
 
 
3602 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.66 
 
 
3040 aa  860    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.29 
 
 
2345 aa  901    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  96.36 
 
 
683 aa  834    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  96.64 
 
 
2530 aa  4489    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  78.03 
 
 
658 aa  985    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  66.67 
 
 
1077 aa  929    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
2545 aa  5073    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  38.77 
 
 
3300 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.12 
 
 
2421 aa  545  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  43.84 
 
 
3322 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  95.33 
 
 
397 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  65.84 
 
 
412 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  65.39 
 
 
640 aa  467  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  65.98 
 
 
599 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.94 
 
 
3020 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  36.22 
 
 
3526 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  33.45 
 
 
3004 aa  396  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.59 
 
 
3028 aa  393  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  31.01 
 
 
1998 aa  389  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.77 
 
 
3079 aa  373  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.42 
 
 
3301 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  50.75 
 
 
4966 aa  360  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  38.73 
 
 
3501 aa  359  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  31.56 
 
 
2984 aa  353  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.25 
 
 
3884 aa  352  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.97 
 
 
3475 aa  352  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  38.34 
 
 
3552 aa  351  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.64 
 
 
3378 aa  346  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.82 
 
 
3480 aa  345  9e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.13 
 
 
3785 aa  323  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  51.18 
 
 
660 aa  322  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0582  putative adhesin/hemolysin  59.7 
 
 
265 aa  301  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.588513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  31.47 
 
 
3165 aa  276  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.03 
 
 
3081 aa  273  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  33.68 
 
 
5212 aa  265  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  32.41 
 
 
3563 aa  265  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  31.37 
 
 
3443 aa  264  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  32.19 
 
 
2758 aa  258  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.9 
 
 
5981 aa  253  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.44 
 
 
6274 aa  253  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.83 
 
 
3128 aa  246  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  38.72 
 
 
594 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.17 
 
 
2670 aa  238  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.58 
 
 
1730 aa  238  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  30.15 
 
 
2061 aa  232  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  34.24 
 
 
710 aa  232  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  38.59 
 
 
857 aa  224  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.06 
 
 
428 aa  214  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1625  hypothetical protein  97.25 
 
 
351 aa  203  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.88 
 
 
812 aa  202  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  38.49 
 
 
2449 aa  193  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  33.4 
 
 
541 aa  192  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.58 
 
 
2827 aa  188  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  30.05 
 
 
1052 aa  185  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.94 
 
 
1723 aa  181  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  36.17 
 
 
1038 aa  179  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  37.97 
 
 
1719 aa  177  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  38.22 
 
 
2350 aa  177  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  37.37 
 
 
1270 aa  174  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  30.86 
 
 
991 aa  173  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  28.4 
 
 
2904 aa  172  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.27 
 
 
721 aa  169  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  35.55 
 
 
463 aa  165  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.6 
 
 
923 aa  165  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  31.49 
 
 
915 aa  164  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  27.93 
 
 
2737 aa  158  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  31.35 
 
 
763 aa  159  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  33.43 
 
 
463 aa  154  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.43 
 
 
463 aa  154  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  28.35 
 
 
2536 aa  146  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  35.28 
 
 
1489 aa  145  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  30.45 
 
 
914 aa  141  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  30.45 
 
 
905 aa  139  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  30.45 
 
 
905 aa  139  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  27.88 
 
 
2691 aa  139  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  29.21 
 
 
2751 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  33.56 
 
 
1635 aa  138  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  30.24 
 
 
911 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.38 
 
 
2786 aa  135  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  21.39 
 
 
2732 aa  135  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.53 
 
 
2818 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  31.34 
 
 
3929 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  21.97 
 
 
2547 aa  132  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>