125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02101 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  76.92 
 
 		 2751 aa  3353    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 2691 aa  5254    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  54.25 
 
 		 2737 aa  943    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  40.37 
 
 		 2536 aa  1190    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  66.81 
 
 		 2786 aa  2372    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.17 
 
 		 2847 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.27 
 
 		 2818 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  32.6 
 
 		 3929 aa  599  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.87 
 
 		 2666 aa  559  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  31.75 
 
 		 2204 aa  520  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  34.9 
 
 		 1841 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  35.44 
 
 		 1035 aa  357  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  36 
 
 		 761 aa  194  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.56 
 
 		 2827 aa  190  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.68 
 
 		 3967 aa  178  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.37 
 
 		 3796 aa  176  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.13 
 
 		 2421 aa  175  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  29.95 
 
 		 3322 aa  173  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7338  adhesin  80.81 
 
 		 99 aa  169  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335427  normal  0.411737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  30.71 
 
 		 3501 aa  166  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  30.05 
 
 		 3552 aa  164  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.86 
 
 		 3040 aa  163  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  28.25 
 
 		 2588 aa  162  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.34 
 
 		 3602 aa  160  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.25 
 
 		 2545 aa  159  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.48 
 
 		 3141 aa  159  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.02 
 
 		 3144 aa  159  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  28.13 
 
 		 2530 aa  157  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  33.52 
 
 		 2758 aa  157  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  26.15 
 
 		 3350 aa  157  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.44 
 
 		 2600 aa  157  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.76 
 
 		 3128 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  35.68 
 
 		 6274 aa  156  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  29.06 
 
 		 3131 aa  155  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.2 
 
 		 3159 aa  152  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  32.21 
 
 		 5212 aa  152  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.64 
 
 		 3079 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  26.99 
 
 		 1489 aa  148  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.12 
 
 		 3147 aa  148  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  29.41 
 
 		 3004 aa  148  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  33.95 
 
 		 3443 aa  147  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  28.5 
 
 		 3081 aa  146  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.29 
 
 		 3862 aa  146  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.95 
 
 		 3020 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  37.77 
 
 		 594 aa  144  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  38.49 
 
 		 3563 aa  143  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.9 
 
 		 2345 aa  141  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28 
 
 		 3028 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.84 
 
 		 1730 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.24 
 
 		 3785 aa  140  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.72 
 
 		 658 aa  140  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.92 
 
 		 3790 aa  139  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.69 
 
 		 2670 aa  137  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  96.88 
 
 		 75 aa  135  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  32.37 
 
 		 3141 aa  135  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  54.78 
 
 		 980 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  30.65 
 
 		 1998 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  28.57 
 
 		 2984 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.51 
 
 		 3301 aa  130  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.47 
 
 		 1723 aa  130  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  42.51 
 
 		 306 aa  128  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  30.87 
 
 		 1651 aa  127  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.59 
 
 		 812 aa  126  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  28.71 
 
 		 1270 aa  126  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.85 
 
 		 5981 aa  125  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.1 
 
 		 3884 aa  125  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  28.38 
 
 		 3165 aa  123  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.77 
 
 		 3378 aa  122  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 		 3475 aa  122  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.77 
 
 		 3480 aa  122  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  30.82 
 
 		 2449 aa  121  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.25 
 
 		 2782 aa  119  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.11 
 
 		 1508 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.7 
 
 		 1508 aa  114  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.26 
 
 		 923 aa  114  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.04 
 
 		 1508 aa  111  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.53 
 
 		 678 aa  111  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.24 
 
 		 721 aa  107  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.41 
 
 		 1615 aa  105  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.81 
 
 		 1508 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  25.9 
 
 		 1635 aa  103  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  25.87 
 
 		 1745 aa  102  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.4 
 
 		 678 aa  102  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  25.48 
 
 		 1618 aa  94.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  29.89 
 
 		 716 aa  93.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.69 
 
 		 846 aa  92.8  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  26.43 
 
 		 898 aa  91.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  26.55 
 
 		 914 aa  91.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  26.43 
 
 		 905 aa  90.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  26.43 
 
 		 905 aa  90.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  26.33 
 
 		 901 aa  90.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  26.43 
 
 		 911 aa  90.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  26.11 
 
 		 893 aa  90.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.55 
 
 		 846 aa  88.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.82 
 
 		 681 aa  84.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  51.9 
 
 		 330 aa  84  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2785  hypothetical protein  39.84 
 
 		 278 aa  82.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  26.3 
 
 		 1719 aa  82.8  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  22.49 
 
 		 2651 aa  82.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.38 
 
 		 847 aa  81.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>